克隆JS代码可能会导致整个HTML表乱的原因有以下几点：

1. 元素ID冲突：如果克隆的JS代码中包含有元素的ID，并且克隆的代码被插入到HTML表中，可能会导致多个元素具有相同的ID，从而引发冲突。ID在HTML中应该是唯一的，如果出现重复，会导致JavaScript无法准确地找到对应的元素，从而导致表的布局混乱。
2. 事件绑定问题：如果克隆的JS代码中包含有事件绑定，例如点击事件、鼠标移动事件等，当克隆的代码被插入到HTML表中时，事件绑定可能会出现问题。如果事件绑定是通过元素的ID来实现的，由于克隆代码中的元素ID与原始表中的元素ID相同，可能会导致事件绑定冲突或失效，进而导致整个HTML表的功能异常或布局混乱。
3. 元素位置问题：克隆的JS代码可能会改变HTML表中元素的位置。如果克隆的代码被插入到HTML表的不同位置，可能会导致原本在正确位置的元素被移动到其他位置，从而导致整个HTML表的布局混乱。

为了避免克隆JS代码导致HTML表混乱的问题，可以采取以下措施：

1. 避免使用重复的元素ID：确保克隆的代码中不包含与HTML表中已有元素相同的ID，可以通过为克隆的元素添加唯一的后缀或前缀来避免冲突。
2. 动态生成唯一的元素ID：如果克隆的代码中需要使用元素ID，可以通过动态生成唯一的ID来避免冲突。可以使用JavaScript生成唯一的ID，并将其应用于克隆的元素。
3. 使用事件委托：如果克隆的代码中包含事件绑定，可以考虑使用事件委托的方式来绑定事件。事件委托将事件绑定到父元素上，通过事件冒泡机制来处理子元素的事件，可以避免克隆代码中的事件绑定冲突问题。
4. 注意克隆代码的插入位置：在将克隆的代码插入到HTML表中时，要注意插入的位置，确保不会破坏原有的布局结构。可以选择合适的插入点，或者使用特定的插入方法，如appendChild()、insertBefore()等。

总之，克隆JS代码可能会导致HTML表混乱的问题，需要注意避免元素ID冲突、事件绑定问题和元素位置问题。合理处理克隆代码的插入和元素ID的唯一性，使用事件委托等技术可以有效避免这些问题的发生。