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【直播】基因组 37:gwas研究结果身上得到了验证

前面讲到了480万变异里面里面有一些在dbSNP数据库里面记录着可能是somatic变异,让有点担心,尤其是还看到了好几个MUC系列基因,主要是黏液素家族基因,而Mucin gene expression...emedicine.medscape.com/article/994656-treatment http://emedicine.medscape.com/article/994656-medication 本文重点是探究如何把现有的研究结果全基因组测序数据结合起来...搜索关键词是:Otitis Media With Effusion gene ,谷歌可以得到一系列结果,当然需要你英文水平还行才能看下去。...European descent retained for analysis at CHOP together with 1219 cases and 1,067 controls at Generation R....也就是这个科学团体研究了近万人才得到了这个可疑位点,跟OME显著相关。 前面我们已经把vcf文件添加了dbSNP标签,简单搜索一下发现,的确有这个变异,唉。

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为什么R语言不能默认显示英文呢

在安装R语言时候设置取消勾选’Message translation‘选项即可。--仅windows需要设置,mac本来就是英文 1.为什么我们偏爱英文提示和报错?...因为学习新技能,怎么样都要遇到问题并解决问题,英文报错信息更容易搜索得到答案,而中文就不怎么好搜。mac同学就不用看了,默认就是英文,不用设置。...而天煞windows默认就是中文,不设置就难受死啦。...3.一劳永逸办法 需要在安装R语言软件时候慢着点,有这样一个页面 其中第三个选项-Message translations,默认是勾上,把它取消勾选,继续安装就会是英文啦,就不用一次次设置啦...经常有人问:安装时候设置了语言是英文,怎么没有用呢?那是因为没选对地方,仅仅是设置了"安装时语言",就是安装向导文字,和使用时文字没有关系。 悟了吗~

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    明明结果是对为什么被合并查询后得到结果却出错了?| Power Query躲坑

    最近,有位朋友在一个实际工作问题中,在表2使用合并查询从表1结果匹配最高(阶段)项,眼看着表1结果是对,但表2里却得到了错误返回结果,具体情况如图所示: 为什么会这样?...我们先来看表1处理情况。 为了合并查询得到最高阶段项,对表1进行降序排序: 然后通过删除重复项保留最高阶段数据: 从表1结果来看,的确保留了最高阶段数据。...然后,在表2里使用合并查询获取表1结果并展开: 咦!!! 表1处理结果明明是阶段4(报价),为什么合并查询得到结果却是阶段2(售前)? 这难道是Power QueryBug吗?...这里问题根源其实是表1处理问题,以往发布多篇文章案例,在涉及Power Query中使用排序问题时会强调,Power Query排序需要增加添加索引或Table.Buffer步骤,使排序结果真正...而这些问题发现和解决,一般需要对Power Query基础知识和一些特性(问题)比较熟悉,前期也针对学习PQ容易碰到问题写过一些文章、录过一些视频,建议大家可以多了解: Power Query新手经常问几个操作问题

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    #PY小贴士# PyCharm为什么执行结果很诡异?

    今天讲这个小问题,没有用过 PyCharm 同学会完全不知所云,但用过的人,可能有一半以上概率会遇到这个算不上 bug 但也可能让人迷惑坑。...情况就是:当你写了一段代码,点击 PyCharm 右上角绿色小三角运行程序时,发现结果跟你预期完全不相干。然后,无论你怎么修改代码,结果丝毫不会改变。甚至你一怒之下删光所有代码,竟然仍有输出!...其实原因也很简单:在 PyCharm里面,切换了当前编辑 py 文件后,默认运行代码文件是不会跟着变。这时候用快捷键或者点运行按钮执行都还是一开始设定那个代码文件。 ?...---- 在 #PY小贴士#里,我们会分享一些 python 知识点、开发小技巧、容易踩到坑,以及学员遇到并在群里提到真实问题。篇幅尽量短小,适合碎片时间阅读,欢迎关注!...也可向本栏目投稿,分享你开发经验。采纳后将署名发表,并可附上个人博客、公众号、Github等介绍。 ----

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    为什么 Pi 会出现在正态分布方程

    本篇文章将介绍钟形曲线是如何形成,以及π为什么会出现在一个看似与它无关曲线公式。...最近在翻阅一本旧统计教科书时发现了一个熟悉正态分布方程: 任何在大学上过统计学课程的人都遇到过这个等式。...自己也看过很多次了,但这次重新看,立刻想到了两个问题: 这东西究竟是如何形成正态分布? π在那里做什么? 第一个问题似乎很简单也很容易弄清楚:只需要学习方程产生历史然后将其逐个拼凑起来。...,并且 e 形成钟形曲线形状: 钟形曲线方程一般方程被提升为二次方程: 为了将其限制为凹二次方程,可以执行以下替换: 将这些代入并重新排列后得到以下结果,这几乎与我们在顶部开始等式完全相同...希望这篇文章可以让你直观地理解为什么 π 似乎突然出现在与它无关曲线公式

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    R语言基于协方差SEM结构方程模型拟合指数

    p=10165 ---- 在实践, 因子负载较低(或测量质量较差)模型拟合指数要好于因子负载较高模型。...例如,如果两个模型具有相同错误指定级别,并且因子负载为.9模型RMSEA可能高于.2,而因子负载为.4模型RMSEA可能小于.05。本文包含一些图表,可以非常清楚地传达这些结果。...c p = (δ / σ )2ncp=(δ/σ)2 Ñ Ç pncpχ 2χ2δδ  遵循以下决策规则:  所有这些 在R实现。 ...delta = .4,因子加载标准意味着如果模型缺少因子加载并且因子加载大于.4。默认情况下,delta = .1。根据SSV建议,这足以解决相关错误。因此,仅使用选择相关错误作为输出。...潜在变量模型测量质量和拟合指数截止之间棘手关系。“人格评估杂志”。

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    R语言基于协方差SEM结构方程模型拟合指数

    p=10165 ---- 在实践, 因子负载较低(或测量质量较差)模型拟合指数要好于因子负载较高模型。...例如,如果两个模型具有相同错误指定级别,并且因子负载为.9模型RMSEA可能高于.2,而因子负载为.4模型RMSEA可能小于.05。本文包含一些图表,可以非常清楚地传达这些结果。...c p = (δ / σ )2ncp=(δ/σ)2 Ñ Ç pncpχ 2χ2δδ  遵循以下决策规则:  所有这些 在R实现。 ...delta = .4,因子加载标准意味着如果模型缺少因子加载并且因子加载大于.4。默认情况下,delta = .1。根据SSV建议,这足以解决相关错误。因此,仅使用选择相关错误作为输出。...潜在变量模型测量质量和拟合指数截止之间棘手关系。“人格评估杂志”。

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    一年编程生涯得到经验教训

    一年编程生涯得到经验教训 一年前,还是一个新鲜出炉刚毕业学生,刚开始在Rocketrip工作。经过一年时间,学到了很多东西。...常常在想,要是能早点知道这些针对应届毕业生技巧,那么从学生到员工转变道路将会顺畅得多。 ? ps:顺序先后没有特定含义 1.对工作激情能大大提升你工作质量。...3.95%电子邮件没必要立即回应。这个比例可能有待商榷,但我想说明是需要立即响应电子邮件数量是非常少。匆匆忙忙回复每一个进来电子邮件,其成本会很高。你可以设置你手机至半小时后提醒。...不要依赖于你周围的人给你设定预期。如果给你预期工作量比你认为你应该做多,那么也许这家公司并不适合你。同时,竭尽全力工作,即使结果比你预期要多。 9.做业余项目。...赞同要将大部分生产时间用于工作,但我也认为应该做一些自己业余项目。博客、项目、等等,都可以。 10.不断学习。自学一些你认为需要和感兴趣东西。 11.为待做事件列一个清单。

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    广义估计方程和混合线性模型在R和python实现

    广义估计方程和混合线性模型在R和python实现欢迎大家关注全网生信学习者系列:WX公zhong号:生信学习者Xiao hong书:生信学习者知hu:生信学习者CDSN:生信学习者2介绍针对某个科学问题...,可以得到回归系数及其方差一致性估计混合线性模型(mixed linear model,MLM):它是一类对误差进行精细分解成对固定效应和随机效应等误差广义线性模型方法,相比广义线性模型而言,它能处理纵向数据...广义估计方程(generalized estimating equations,GEE)建立结果变量y与协变量Z之间(每个协变量内含有对应自变量X)函数关系建立y方差与平均值之间函数关系对y构建一个...患者随机效应捕捉了在患者之间GFR变异性,这不能由固定效应解释# 第一种方法# library(lmerTest)# mlm_fit <- lmerTest::lmer(GFR ~ age + gender...(R、Python、SPSS实现)混合线性模型介绍--Wiki广义估计方程工作相关矩阵选择及R语言代码在Rstudio 中使用pythonAn Introduction to Linear Mixed

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    为什么要创建一个不能被实例化

    但如果有一天,你发现写了这样一个类: class People: def say(self): print(f'叫做:{self.name}') def __new...一个不能被初始化类,有什么用? 这就要引入我们今天讨论一种设计模式——混入(Mixins)。 Python 由于多继承原因,可能会出现钻石继承[1]又叫菱形继承。...显然,这样写会报错,因为两个类实例是不能比较大小: 但在现实生活,当我们说 某人比另一个人大时,实际上是指某人年龄比另一人年龄大。...但是 在写 Mixins 类时候,我们不会写__init__方法,也不会写类属性。并且 Mixin 类方法看起来更像是工具方法。 我们可以写很多个 Mixin 类,然后用一个子类去继承他们。...由于这些 Mixin 类提供各个工具方法互不相关,所以不存在菱形继承问题。但是在子类却可以分别调用这些工具方法,从而扩展子类功能。

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    面试官:为什么Promise错误不能被trycatch?

    前言 之前写过一篇文章,讨论了为什么async await错误可以被try catch,而setTimeout等api不能,有小伙伴提出之前面试被面试官问过为什么Promise错误不能try catch...,为什么要这么设计。...为什么要引入Promise?...异步处理在我们日常开发是很常见场景,在Promise出现之前,我们都是通过回调来处理异步代码结果,但是出现了一些问题: 回调地狱,在有多个异步逻辑存在依赖关系时,我们只能在回调里嵌套,这些深度嵌套代码让代码难以阅读和维护...在这里没有去处理finally handler可能出现错误,这样代码调用方既可以处理结果也可以处理错误,而我可以保证打开一些副作用被正确销毁(比如这里隐藏loading)。

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    在vuev-for,key为什么不能用index?

    写在前面在前端,主要涉及基本上就是 DOM相关操作 和 JS,我们都知道 DOM 操作是比较耗时,那么在我们写前端相关代码时候,如何减少不必要 DOM 操作便成了前端优化重要内容。...DOM 更新操作Vue 源码 diff 算法patch.js 路径Vue diff 算法相关代码主要在 patch.js 文件,路径如下图图片patch 函数图片1、如果新节点不存在(vnode...,调用 patchVnode 比较子元素差异,指针往前走一步5、若前面4种情况都没有命中,则将遍历新节点,将子节点组个与旧节点子节点进行一一比较,逐个遍历对比,没有匹配到则直接重建元素diff 算法...Key 值从 diff 算法 updateChildren 函数我们知道,采用双端 diff 算法会进行新开始、结束节点和旧开始、结束节点做对比,当都没有匹配上时候会采用完全遍历方式进行一一比较...,体会到了前端对于性能极致追求,通过通读 vdom 源码,基本能够从更加深刻角度去理解采用 VDOM 目的,以及 key 值在 diff 算法真正作用,也能够从更加底层角度理解为什么不推荐使用

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    为什么 Vuex mutation 和 Redux reducer 不能做异步操作?

    (() => { state.count++ }) } } 现在想象,我们正在 debug 一个 app 并且观察 devtool mutation 日志。...然而,在上面的例子 mutation 异步函数回调让这不可能完成:因为当 mutation 触发时候,回调函数还没有被调用,devtools 不知道什么时候回调函数实际上被调用——实质上任何在回调函数中进行状态改变都是不可追踪...Redux 先从Redux设计层面来解释为什么Reducer必须是纯函数 如果你经常用React+Redux开发,那么就应该了解Redux设计初衷。...Redux设计参考了Flux模式,作者希望以此来实现时间旅行,保存应用历史状态,实现应用状态可预测。...所以整个Redux都是函数式编程范式,要求reducer是纯函数也是自然而然事情,使用纯函数才能保证相同输入得到相同输入,保证状态可预测。

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    在vuev-for,key为什么不能用index?4

    写在前面在前端,主要涉及基本上就是 DOM相关操作 和 JS,我们都知道 DOM 操作是比较耗时,那么在我们写前端相关代码时候,如何减少不必要 DOM 操作便成了前端优化重要内容。...DOM 更新操作Vue 源码 diff 算法patch.js 路径Vue diff 算法相关代码主要在 patch.js 文件,路径如下图图片patch 函数图片1、如果新节点不存在(vnode...,调用 patchVnode 比较子元素差异,指针往前走一步5、若前面4种情况都没有命中,则将遍历新节点,将子节点组个与旧节点子节点进行一一比较,逐个遍历对比,没有匹配到则直接重建元素diff 算法...Key 值从 diff 算法 updateChildren 函数我们知道,采用双端 diff 算法会进行新开始、结束节点和旧开始、结束节点做对比,当都没有匹配上时候会采用完全遍历方式进行一一比较...,体会到了前端对于性能极致追求,通过通读 vdom 源码,基本能够从更加深刻角度去理解采用 VDOM 目的,以及 key 值在 diff 算法真正作用,也能够从更加底层角度理解为什么不推荐使用

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    Science:超过一半顶刊癌症研究结果不能重复

    但由于成本上涨及很难得到合适材料,项目最终削减到 18 个,其中 13 个重复项目在 eLife 已经发表:6 个大部分是可重复,4 个是不确定,3 个研究是否定,超过一半研究论文结果不能被重现...怎么规避不能重复实验,主要有以下方面:研究文章需要披露更多实验细节,从原来研究团队得到原始材料,原始研究需花更多时间排除假阳性结果等方面。 ?...该项目已经发布了 eLife 期刊 18 项研究 13 项复制结果结果是混合:6 个大部分是可重复,4 个是不确定,3 个研究是否定,但最初发现已得到其他实验室证实。...图片来源:Elife 【1】结论 1 不能重复:与 CD44-LAPC4 细胞相比,从异种移植肿瘤(LAPC4 细胞)纯化 CD44 + 前列腺癌细胞 microRNA miR-34a 表达水平是其两倍...3 不能重复:测试 miR-34a 是否通过 3'UTR 结合位点调节 CD44 时,结果显示没有统计学上显著差异,而最初研究报道 miR-34a 降低 CD44 表达,其通过突变结合位点而部分消除

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    为什么 GROUP BY 之后不能直接引用原表

    为什么 GROUP BY 之后不能直接引用原表(不在 GROUP BY 子句)列 ? 莫急,我们慢慢往下看。...; View Code     能正常执行了,但是一般情况下不推荐这样配置,线上环境往往是“严格模式”,而不是“宽松模式”;虽然案例,无论是“严格模式”,还是“宽松模式”,结果都是对,那是因为 cno...通过上图,相信大家也都能看到,这里不做更深入讲解了,有兴趣可以去查相关资料。 为什么聚合后不能再引用原表列   很多人都知道聚合查询限制,但是很少有人能正确地理解为什么会有这样约束。...SQL 世界其实是层级分明等级社会,将低阶概念属性用在高阶概念上会导致秩序混乱,这是不允许。此时相信大家都明白:为什么聚合后不能再引用原表列 。...SELECT 子句中不能直接引用原表原因;   3、一般来说,单元素集合属性和其唯一元素属性是一样

    1.7K10

    为什么你写拦截器不能注入Java bean?

    这时候就需要提供一个验证token有效性接口,在拦截器验证token,由于拦截器是Spring提供,因此很容易想到使用@Component注解将拦截器注成一个 bean。...明明代码写没问题,为什么不能正常注入TokenUtil呢?...仔细观察我们自定义配置类WebConfiguration,在添加拦截器时候用是new LoginInterceptor(),如果想要拦截器生效,必须将拦截器配置到WebMvc配置类,就是我们自定义...token业务类,然后在初始化拦截器时候将业务类通过构造器带入拦截器,这样就不用把拦截器注成Spring Bean对象了。...这是一种错误做法。我们需要保证是在WebMvc配置类添加拦截器是Spring 一个bean对象,也就是说我们需要将拦截器注成一个bean,同时将这个bean添加WebMvc配置类

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    用编程模拟疫情传播来告诉你: 为什么现在你还不能出门

    看完视频你就明白为什么不能出门了,千万不要放松警惕!(@Ele实验室 ) 在家憋了一段时间的人们,耐心也在一点一点消磨。很多人已经忍不住开始想蠢蠢欲动了。...他们总有一套自己理论:我们城市才一点确诊病人,而且在距离我们很远地方,就出去一会儿,哪有那么巧合,就感染上了。没事儿!大街上都没人,戴着口罩又没事。...因此通过这一次疫情防控,为了你、、他,请以后感冒发烧生病之后,能够带个口罩,减少传染率。因为不知道你体内这一个病毒威力如何。 ?...希望大家不要抱着侥幸心理!尤其是这几天,很多地方天气变好了,感觉疫情已经得到了控制,但是放松警惕时候恰恰是最危险时候!...当确诊病例不再上升,没有疑似病例出现,那么我们就基本可以清楚疫情已经基本得到控制。那时才是真正春天到来。 切记切记: 普通人对抗疫情最好办法就是:能不出门就不出门。

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    Javastatic用法,static、public为什么不能修饰局部变量?

    4.数据存储不一样 成员变量储存在堆内存对象,也叫对象特有数据。 静态变量储存在方法区静态区,所有也叫对象共享数据。...静态方法不能访问非静态成员方法和非静态成员变量,但是在非静态成员方法是可以访问静态成员方法/变量。当然静态可以访问静态,非静态可以访问非静态。...可以直接通过类名来访问,访问语法为: 类名.静态方法名(参数列表…) 类名.静态变量名 static代码块 static代码块在jvm加载类时候会自动执行,但是static代码块不能在方法内...可以 System.out.println(b); //非静态访问非静态变量,可以 TestStatic.StaticMethod();//非静态访问静态方法,可以 } } 运行结果...{ n += j; j++; System.out.println("j="+j); if (n >= 5) return n; return n+ f2(n); } 结果

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