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「R」data.table 包功能特性学习

data.table包提供了一个加强版的data.frame。它运行效率极高，而且能够处理适合内存的大数据集。它通过[ ]实现了一种自然的数据操作语法。...语法格式： DT[i, j, by] 释义为对data.table对象DT，使用i选择行，然后按照by计算j。...如果你还没有安装该包，运行： install.packages("data.table") 导入包 library(data.table) 创建一个data.table set.seed(45L)...# 返回第二列为一个向量 DT[, V2] ## [1] "A" "B" "C" "A" "B" "C" "A" "B" "C" "A" "B" "C" # 返回第二列与第三列为一个data.table...DT[, sum(V1)] ## [1] 18 # 返回V1列的和，V3列的标准差为一个data.table DT[, .

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R海拾遗--data.table初级学习

data.table初级学习概述 data.table对于大数据的数据整理较为便捷，很多的时候比data.frame效率更高，一般情况下结合管道符号进行计算管道符 %in% 表示包含 %>% 表示向右传递...%$% 表示向右传递并直接按列操作安装 install.packages("data.table") install.packages("magrittr") library(magrittr) library...(data.table) 使用方法简单操作 iris% as.data.table() class(iris) # 行数 nrow(iris) # 列数 ncol(iris)...# 列名 names(iris) # 选取列 iris[ , Species] # 返回一组向量 iris[ , ....(Species)] #返回一个data.table iris[, c("Species"), with=FALSE] #返回一组数据框 # 保留多列 iris[, .

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「R」数据操作（三）：高效的data.table

接「R」数据操作（一）和「R」数据操作（二）使用data.table包操作数据 data.table包提供了一个加强版的data.frame，它运行效率极高，而且能够处理适合内存的大数据集，它使用[].../R/dataset/product-info.csv") product_stats = fread("../...../R/dataset/product-tests.csv") toy_tests = fread("../.....来完成这个任务，使用setDT()将数据框转换为data.table，该函数可以原地转换，不需要复制，并可以设定键。...为演示，我们先创建新的data.table，命名为market_data，其中date列是连续的。

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R语言：data.table语句批量生成变量

我们在对多列标准进行筛选时，在之前我们还进行了一步非常重要的提取，也就是将每一列观察值提取出某一特定的字段，而后生成一系列变量，这些变量的观测值只可能存在三种情况：醛固酮、继发性醛固酮或者NA。...经过这样的处理我们才能进行上一期公众号所讲述的下一步：以多列标准进行筛选的操作。...:= 右边关于 ':= lapply' 的用法，在这里小编不再赘述，如果大家对此不是很熟悉可以看这一期公众号：用data.table语句批量处理变量。...大猫的R语言课堂我是大猫，一个高中读文科但却在代码、数学的路上狂奔不止的Finance Ph. D Candidate。我是村长，一个玩了9年指弹吉他，却被代码深深吸引的博士候选人。...大猫的微信号是： iRoss2007 村长的B站主页是：http://space.bilibili.com/40771572 大猫的R语言课堂关注R语言、数据挖掘以及经济金融学。

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R语言高级数据结构data.table

今天给大家介绍一个升级版的data.frame，其不仅可以存储不同数据类型还可以进行多列的并行运算。包的安装我们就不再赘述了（install.packages(“data.table”)）。...as.data.table 将R对象转化为data.table格式的数据，其对象可以为列表，向量，data.frame。...setDT(x) 其直接将R对象转化为data.table数据类型，从而不改变数据地址。...列的选取也发生了改变，其中引入了list的别名 .() 进行数据筛选： DT[,y] DT[,.(y)] ?...其中数据各列的增加，删除，修改，用到的函数是:=。 DT[,y1:=y] DT[,y:=NULL] DT[,y:=(y+1)] ?

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PQ基础-数据转换4：删列、移列、添加索引列

本文通过一个例子，综合体现常用的删列、移列、添加索引列操作方法。数据样式及要求如下：要求： 1. 删除状态列； 2....将货币列移动到合同总金额的后面； 3. 添加以1为起始的索引列。...Step-1：获取数据 Step-2：删除列 Step-3：移动列 Step-4：添加以1为开始的索引列 Step-5：上载数据

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5个例子比较Python Pandas 和R data.table

Python和R是数据科学生态系统中的两种主要语言。它们都提供了丰富的功能选择并且能够加速和改进数据科学工作流程。...在这篇文章中，我们将比较Pandas 和data.table，这两个库是Python和R最长用的数据分析包。我们不会说那个一个更好，我们这里的重点是演示这两个库如何为数据处理提供高效和灵活的方法。...data.table) melb <- fread("datasets/melb_data.csv") 示例1 第一个示例是关于基于数据集中的现有列创建新列。...Price > 1000000 & Type == "h"] 对于pandas，我们提供dataframe的名称来选择用于过滤的列。...作者：Soner Yıldırım 原文地址：https://towardsdatascience.com/5-examples-to-compare-python-pandas-and-r-data-table

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【R语言】data.table让你的读取速度提升百倍

今天小编给大家安利一个实用的R包data.table, 这个包可以明显的提升大文件的读取速度。下面我们就来做一个实验。...我们随机生成一个100万行10列的文件，保存到你的电脑上，文件的大小可以达到173MB。...接下来我们分别用传统的read.csv和data.table包里面的fread函数来读取这个超大的文件，然后比较两种方法的读取速度。...# 加载data.table包 library(data.table) # 数据读取性能对比分析 # Create a large .csv file set.seed(100) m <- data.frame...taken by fread to import system.time({m_dt <- fread('m2.csv')}) 我们可以看到传统的read.csv读取该文件所需要的时间为48.84秒，而利用data.table

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R语言学习笔记之——数据处理神器data.table

data.table 1、I/O性能： data.table的被推崇的重要原因就是他的IO吞吐性能在R语言诸多包中首屈一指，这里以一个1.6G多的2015年纽约自行车出行数据集为例来检验其性能到底如何，...rm(list=ls()) gc() 2、索引切片聚合 data.table中提供了将行索引、列切片、分组功能于一体的数据处理模型。...data.table列索引列索引与数据框相比操作体验差异比较大，data.table的列索引摒弃了data.frame时代的向量化参数，而使用list参数进行列索引。...左手用R右手Python系列——数据合并与追加长宽转换：长宽转换仍然支持plyr中的melt/dcast函数以及tidyr中的gather/spread函数。...本篇仅对data.table的基础常用函数做一个整理，如果想要学习期更为灵活高阶的用法，还请异步官方文档。左手用R右手Python系列——数据塑型与长宽转换

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R语言列筛选的方法--select

我们知道，R语言学习，80%的时间都是在清洗数据，而选择合适的数据进行分析和处理也至关重要，如何选择合适的列进行分析，你知道几种方法？如何优雅高效的选择合适的列，让我们一起来看一下吧。 1....r$> library(learnasreml) r$> data(fm) r$> head(fm) 「我们的目的：」 ❝提取fm的TreeID，Rep，dj，dm，h3，并重命名为：ID,...使用R语言默认的方法：列选择这一种，当然是简单粗暴的方法，想要哪一列，就把相关的列号提取出来，形成一个向量，进行操作即可。...> names(d1) = c("ID","F1","y1","y2","y3") r$> head(d1) 结果：「缺点：」这种方法，需要找到性状所在的列号，然后还要重命名，比较麻烦。...而且，后面如果想要根据列的特征进行提取时（比如以h开头的列，比如属性为数字或者因子的列等等），就不能实现了。这就要用到tidyverse的函数了，select，rename，都是一等一的良将。

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R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

介绍一种按照日期范围——例如按照周、月、季度或者年——对其进行分组的超简便处理方式：R语言的cut()函数。...三、split – apply – combine模式——分组处理模式对数据的转换，可以采用split – apply – combine模式来进行处理： split：把要处理的数据分割成小片断； apply...可以看到，计算结果中的第一列实际上是“SELLERID.CLIENT”，我们需要把它拆分成两列并调换顺序才行。...data.table包的语法简洁，并且只需一行代码就可以完成很多事情。进一步地，data.table在某些情况下执行效率更高。...（参考来源：R高效数据处理包dplyr和data.table，你选哪个？） ?

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生信技能树 Day5 文件读写

，要先转换为R语言对象行名列名是数据框的属性，可以设置，不是数据#1.读取ex1.txtex1 列因列名的加入变成了字符...，如果报错可以把去除重复值（两行求平均合并）R语言转换完要检查一下，看行列名数据有没有变化，及时调整参数改正3....其他读取/导出文件的R包 import最推荐#用data.table来读取library(data.table)ex1 = fread("ex1.txt")class(ex1)## [1] "data.table...,data.table = F)##不支持直接设置行名，设置行名用下面函数实现library(tibble)ex2 = column_to_rownames(ex2,"V1") # 把V1列设为行名#riolibrary...，处理完是什么类型等等R语言能够读取多种文件格式引用自生信技能树

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R语言dataframe数据转换

将宽数据转换为长数据 1 构建数据框df image.png 2....用reshape2::melt将2维数据转换为一维数据 df_melt列 measure.vars vector of measured...Can be integer (variable position) or string (variable name)If blank, will use all non id.vars指明测量值列，...如果不明确说明，默认出id.var列以外的所有列为measure,上列中就没有明确支出measure.vars,则默认2010和2011均为measure value variable.name name

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data.table包使用应该注意的一些细节

也可以循环一次性方便的读入；还有就算后续改变了文件的分隔符，文件也可以读入，建议不加分隔符 fread可以自动检测注释，并且跳过注释行默认skip=0，会跳过不规则的行，因此有注释行时，可以走默认的skip参数转换成矩阵时可以保留某一列为...rowname as.matrix作用于data.table时会调用as.matrix.data.table，有一个rownames参数可以指定保留为行名的列矩阵转换成data.table时可以保留列名... 在as.data.table函数中同样有一个rownames参数，设置为T可以将行名保留下来作为data.table的一列不建议set和for循环一起使用虽然set可以在内存上直接改变数值...，但在R中用for循环比批量列运算慢的多，因此首选:=或者apply等在处理浮点数时会有一些准确性的问题比如用seq函数numeric类型的数值时，会存在不准确的问题，比如seq(0,1,by=... 带有rollup， cube， groupingsets函数参考资料 data.table 1.11.2 manual：https://cran.r-project.org/web/packages

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【R语言】基因ID转换

做数据分析的时候，我们经常需要在各种gene ID之间进行转换。...前面也简单给大家介绍过一些做ID转换的工具 ☞DAVID（https://david.ncifcrf.gov/home.jsp） ☞biomart基因ID转换，获取转录本类型 ☞g:Convert（https...但是当我们在用R处理数据的时候，不希望把基因名字导出来，用网页工具做个转换，再导到R里面，这样很不方便。有没有R包可以直接把ID给转换了，这样整个分析工作就不用切换工具了。答案是肯定的。...今天小编就来给大家介绍两个R包，完成基因ID转换。...方法一、org.Hs.eg.db包假设我们手上有16个m6A甲基化相关的基因symbol，现在想转换成ensemble gene ID和Entrez gene ID。

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「R」数据汇总时自动生成多列

今天在使用dplyr数据分析时遇到一个问题，就是如何在分组汇总时自动生成多列。...8 7.98 10 9 8.96 # … with 11 more rows 只要进一步转换为宽格式就可以完成处理了

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【R语言】数据框按两列排序

假设我们手上有下面这套数据，9个人，第二列（score）为他们的考试成绩，第三列（code）为对应的评级。80分以上为优秀，60-80为良，60以下为差。...我们就会得到如下结果那么这个过程怎么在R里面实现呢？今天我们就来探讨一下。主要用的是R中的order这个函数。...只需要前面加个负号就可以了 View(file[order(file$Code,-file$Score),]) 下面是按照code升序，然后再按score降序排列的结果，是不是跟Excel处理的结果一样在R里面我们还可以指定

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【PostgreSQL系列】列类型从整数转换为 UUID

在某些情况下，我们可能需要将tenant_id列的类型从整数（int）转换为更通用和灵活的 UUID 类型。...测试环境：在测试环境中模拟转换过程，确保转换后的数据库能够正常工作。...转换过程根据提供的信息，我们可以看到两种不同的转换方法：直接转换：首先尝试直接将tenant_id的类型从整数转换为 UUID，但这种方法可能会失败，因为整数和 UUID 是两种完全不同的数据类型，...使用类型转换函数：正确的方法是使用类型转换函数::uuid，这允许数据库将整数类型的tenant_id转换为 UUID 类型。这种方法在转换过程中保留了原有的数据。...public.upload_files ALTER COLUMN tenant_id TYPE uuid USING tenant_id::uuid; 这里，USING tenant_id::uuid告诉数据库将tenant_id列中的每个整数转换为对应的

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R语言基因组数据分析可能会用到的data.table函数整理

版权声明：本文为博主原创文章，转载请注明出处 R语言data.table包是自带包data.frame的升级版，用于数据框格式数据的处理，最大的特点快。...； sep2 对于是list的一列，写出去时list成员间以sep2分隔，它们是处于一列之内，然后内部再用字符分开； eol 行分隔符，默认Windows是"\r\n",其它的是"\n"...默认会猜测现在我需要取数据DT的v1,v2两列相同的情况作为汇总的一类，对它们的v4值取平均，转换如下，转换前...转换后当然，上述过程也可以用data.table[ i , j , by ]语法做但是如果我要将上述DT中的v3作为一个影响因素，作为tag，先按v1、v2汇总，再将对应的v4值分为v3=1和v3...manual: https://cran.r-project.org/web/packages/data.table/data.table.pdf

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R语言数据分析利器data.table包 —— 数据框结构处理精讲

版权声明：本文为博主原创文章，转载请注明出处 R语言data.table包是自带包data.frame的升级版，用于数据框格式数据的处理，最大的特点快。...将一个R对象转化为data.table，R可以时矢量，列表，data.frame等，keep.rownames决定是否保留行名或者列表名，默认FALSE,如果TRUE,将行名存在"rn"行中，keep.rownames...； sep2,对于是list的一列，写出去时list成员间以sep2分隔，它们是处于一列之内，然后内部再用字符分开； eol，行分隔符，默认Windows是"\r\n",其它的是"\n"； na,...(y)] #返回y列，返回data.table DT[, sum(y)] #对y列求和 DT[, ....参考文献 data.table包manual：https://cran.r-project.org/web/packages/data.table/data.table.pdf

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R语言列筛选的方法--select

R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

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R语言dataframe数据转换

data.table包使用应该注意的一些细节

【R语言】基因ID转换

「R」数据汇总时自动生成多列

【R语言】数据框按两列排序

【PostgreSQL系列】列类型从整数转换为 UUID

R语言基因组数据分析可能会用到的data.table函数整理

R语言数据分析利器data.table包 —— 数据框结构处理精讲

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