用于背景荧光/噪声去除的BaselineRemoval包
用于背景荧光/噪声去除的BaselineRemoval包
提问于 2020-08-28 20:46:29
我正在尝试使用BaselineRemoval软件包从一些拉曼光谱中去除背景荧光。在代码文档中，它将输入的首选格式声明为input_array: A pandas dataframe column provided in input as dataframe['input_df_column']. It can also be a Python list object
我的例子是-
df = pd.DataFrame(
{'Patient': [1, 2, 3, 4, 5, 6],
'Group': [1, 1, 1, 2, 2, 2],
'Samples': [list(np.random.randn(3).round(2)) for i in range(6)]
}
)
input_array = df['Samples']
polynomial_degree = 2
baseObj = BaselineRemoval(input_array)
Modpoly_output = baseObj.ModPoly(polynomial_degree)但是，这会产生错误ValueError: setting an array element with a sequence.
不确定如何继续。
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2020-08-28 22:51:32
一个简单的for循环就可以做到这一点。
df = pd.DataFrame(
{'Patient': [1, 2, 3, 4, 5, 6],
'Group': [1, 1, 1, 2, 2, 2],
'Samples': [list(np.random.randn(3).round(2)) for i in range(6)]
}
)
input_array = df['Samples']
polynomial_degree = 2
for row in input_array:
print(BaselineRemoval(row).ModPoly(polynomial_degree))页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/63634066
复制相关文章
相似问题
腾讯云开发者
