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社区首页 >问答首页 >用大熊猫、python组织列和头数据

用大熊猫、python组织列和头数据
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Stack Overflow用户
提问于 2014-09-10 13:15:19
回答 1查看 1.1K关注 0票数 1

我正在尝试使用Numpy而不是Matlab,但我对Python还比较陌生。

我目前面临的挑战是以合理的方式导入多个文件中的数据,这样我就可以使用并绘制它。数据被组织成专栏(温度、压力、时间等,每个文件都是一个测量周期),我认为熊猫可能是导入数据的最佳方式。我在考虑对每个文件使用顶级描述符,为每个列使用子描述符。想做这样的事。Reading Multiple CSV Files into Python Pandas Dataframe

问题是,我希望保留并使用标题中的一些数据(例如,用于绘图)。没有列标题,而是关于数据管理的一般信息,如下所示:

代码语言:javascript
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 Flight ID: XXXXXX
 Date: 01-27-10  Time: 5:25:19
 OWNER
 Release Point: xx.304N  xx.060E  11 m
 Serial Number xxxxxx
 Surface Data:  985.1 mb   1.0 C 100%   1.0 m/s @ 308 deg.

我真的不知道如何以一种与数据框架相结合的方式提取和存储数据。也许想到了一本字典,但我不知道如何有效地分割数据,因为没有一致的分隔符。有什么想法吗?

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回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2016-10-14 16:42:15

好像有人在用收音机..。

当我输入我的无线电探空仪数据时,我通常会把它放在一个多层次的索引数据中。级别可以是不同的形式和顺序,但像FLIGHT_NUM,日期,高度等会有意义。此外,在处理sonde数据时,我也需要一些不一定需要存储在dataframe中的附加信息,所以我将其存储为附加属性。如果我要解析您的文件,然后存储它,我将按照这样的思路做一些事情(是的,有些修改可以“改进”):

代码语言:javascript
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import pandas as pd

with open("filename.csv",'r') as data:
    header = data.read().split('\n')[:5] # change to match number of your header rows
    data = pd.read_csv(data, skiprows=6, skipinitialspace=True, na_values=[-999,'Infinity','-Infinity'])

# now you can parse your header to get out the necessary information
# continue until you have all the header info you want/need; e.g.
flight = header[0].split(': ')[1]
date = header[1].split(': ')[1].split('')[0]
time = header[1].split(': ')[2]

# a lot of the header information will get stored as metadata for me.  
# most likely you want more than flight number and date in your metadata, but you get the point.
data.metadata = {'flight':flight,
                 'date':date}

我假设您的文件中有一个日期/时间列(这里称之为“日期”),所以您可以使用它重新索引您的数据。如果选择在多级索引中使用不同的变量,则应用相同的方法。

代码语言:javascript
运行
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new_index  = [(data.metadata['flight'],r) for r in data.dates]
data.index = pd.MultiIndex.from_tuples(new_index)

现在您有了一个多层次的索引数据格式。

关于你的“元数据”。EdChum提出了一个很好的观点,如果您复制“数据”,就不会复制元数据字典。另外,如果通过data.to_pickle将“数据”保存到数据中,则会丢失元数据(稍后将详细介绍)。如果您想保留元数据,您可以有几个选项。

  1. 按飞行顺序保存数据。这将允许您为每个航班的文件存储元数据。
  2. 假设您希望在一个保存的文件中有多个航班:您可以在dataframe中添加一个包含该信息的额外列(即另一列表示航班号,另一列表示表面温度,等等),但这将增加保存文件的大小。
  3. 假设您希望在一个保存的文件中有多个航班(选项2):您可以按航班号“键控”元数据字典。例如: data.metadata = {FLIGHT1:{'date':date},FLIGHT2:{‘date’:date}

现在存储元数据。检查我的IO类,以便在发布的h5文件中存储其他属性。

你的问题相当广泛,所以你得到了一个广泛的答案。希望这能帮上忙。

票数 1
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/25766446

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