用mkl编译r(支持多读)
关于这些指南，我编译了R：
http://www.r-bloggers.com/compiling-64-bit-r-2-10-1-with-mkl-in-linux/
http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-admin.html#MKL
但是对于矩阵代数，R并不使用所有可用的CPU。
我都试过了：
MKL="-L${MKL_LIB_PATH} -lmkl_gf_lp64 -lmkl_gnu_thread \
-lmkl_core -fopenmp -lpthread"和
MKL=" -L${MKL_LIB_PATH} \
-Wl,--start-group \
${MKL_LIB_PATH}/libmkl_gf_lp64.a \
${MKL_LIB_PATH}/libmkl_gnu_thread.a \
${MKL_LIB_PATH}/libmkl_core.a \
-Wl,--end-group \
-lgomp -lpthread"选项。
如何强制R使用所有可用的CPU？
如何检查R是否使用MKL？
回答 4
Stack Overflow用户
发布于 2014-11-14 22:21:22
这里提供了完整的教程：
https://software.intel.com/en-us/articles/build-r-301-with-intel-c-compiler-and-intel-mkl-on-linux
或者简单地使用：
http://mran.revolutionanalytics.com/download/
Stack Overflow用户
发布于 2013-05-19 09:54:12
我想添加我的过程来使用MKL库编译R 3.0.1。我使用的是Debian7.0的核心i7英特尔处理器，8GRAM。首先，我使用以下命令设置了与MKL相关的环境变量(MKLROOT和LD_LIBRARY_PATH)，然后安装了MKL库：
>source /opt/intel/mkl/bin/mklvars.sh intel64因此，我使用了以下参数来./configure：
>./configure --enable-R-shlib --enable-threads=posix --with-lapack --with-blas="-fopenmp -m64 -I$MKLROOT/include -L$MKLROOT/lib/intel64 -lmkl_gf_lp64 -lmkl_gnu_thread -lmkl_core -lpthread -lm"并使用make和make install完成了安装。
作为基准，我在没有MKL的情况下做了一个介于两个5000 x 5000矩阵产品之间的产品，得到：
用户系统耗时57.455 0.104 29.033
编译后：
用户系统耗时15.993 0.176 4.333
一个真正的收获！
Stack Overflow用户
发布于 2018-04-15 22:18:28
所有这一切现在都变得容易得多--一个简短的blog post is here详细讨论了下面的步骤。
但简而言之，您所需要的就是：
## get archive key
cd /tmp
wget https://apt.repos.intel.com/intel-gpg-keys/GPG-PUB-KEY-INTEL-SW-PRODUCTS-2019.PUB
apt-key add GPG-PUB-KEY-INTEL-SW-PRODUCTS-2019.PUB
## add MKL to apt's repo list
sh -c 'echo deb https://apt.repos.intel.com/mkl all main > /etc/apt/sources.list.d/intel-mkl.list'
## update and install (500+ mb download, 1.9gb installed)
apt-get update
apt-get install intel-mkl-64bit-2018.2-046
## make it system default via update alternatives
update-alternatives --install /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libblas.so libblas.so-x86_64-linux-gnu /opt/intel/mkl/lib/intel64/libmkl_rt.so 50
update-alternatives --install /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libblas.so.3 libblas.so.3-x86_64-linux-gnu /opt/intel/mkl/lib/intel64/libmkl_rt.so 50
update-alternatives --install /usr/lib/x86_64-linux-gnu/liblapack.so liblapack.so-x86_64-linux-gnu /opt/intel/mkl/lib/intel64/libmkl_rt.so 50
update-alternatives --install /usr/lib/x86_64-linux-gnu/liblapack.so.3 liblapack.so.3-x86_64-linux-gnu /opt/intel/mkl/lib/intel64/libmkl_rt.so 50
## tell ldconfig
echo "/opt/intel/lib/intel64" > /etc/ld.so.conf.d/mkl.conf
echo "/opt/intel/mkl/lib/intel64" >> /etc/ld.so.conf.d/mkl.conf
ldconfig就这样。没别的了。没有重新编译或链接。例如，R现在在sessionInfo()中显示：
Matrix products: default
BLAS/LAPACK: /opt/intel/compilers_and_libraries_2018.2.199/linux/mkl/lib/intel64_lin/libmkl_rt.sohttps://stackoverflow.com/questions/14996697
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