python中的群体遗传学建模
python中的群体遗传学建模
提问于 2012-10-07 20:38:38
所以我需要编写一个程序，用一个单一基因产生一个理论有机体的几代随机等位基因。
我从包含一个突变的等位基因2的列表开始，然后为下一代选择3个等位基因，并将它们附加到下一代的列表中
import random
p = [1,1,1,2]
from random import choice
n=len(p)-1
for i an range(n):
p.append(choice(p))问题是，这不会移除没有选择的等位基因。我如何调整这个程序，以使未选择的等位基因从列表中删除？
谢谢
- edit
程序的输出结果如下所示
1,1,1,2,1,2,1
这将代表具有两个不同等位基因的7个有机体的种群。这代表第二代，因为所选的3个等位基因中有双等位基因。这模拟了3个选择的等位基因中的2个后代。但是没有被选择的等位基因(在这种情况下是1)不应该出现在这个世代中。所以我想知道的是如何从这里的列表中删除它
注意：抱歉，我有点罗嗦
回答 2
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2012-10-07 20:55:27
import random
n = 4
A = [i for i in xrange(n)]
B = [1,1,1,2]
NextGeneration = []
for i in xrange(n-1):
last = n - i - 1
actualChoice = random.randint(0,last)
NextGeneration.append(B[A[actualChoice]])
auxSwap = actualChoice
A[actualChoice] = A[last] Stack Overflow用户
发布于 2012-10-07 21:03:50
我不确定我是否完全理解你的问题，但这里有一个解决方案的尝试：
first_gen = [1,1,1,2]
second_gen = first_gen + random.sample(first_gen, len(first_gen)-1)这真的有帮助吗？
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/12768911
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