Loading [MathJax]/jax/input/TeX/config.js
首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
首页
学习
活动
专区
圈层
工具
MCP广场
社区首页 >问答首页 >在使用CNVkit确定的时候 如何使用扩增子测序??

在使用CNVkit确定的时候 如何使用扩增子测序??

提问于 2020-02-07 14:10:31
回答 0关注 0查看 231

这一部分的信息没太看懂,跪求大神帮忙!!!!

回答

成为首答用户。去 写回答
相关文章
CNVkit的使用方法--肿瘤基因组测序数据分析专栏
在进行肿瘤基因组数据分析时,拷贝数变异分析是常用的分析要点之一。CNVkit 则是用于基因组测序 WGS 和 WES 进行 call CNV 的工具之一,基于python 编写,给出的 CNV 结果相对可靠,操作起来也比较简单。
生信菜鸟团
2021/12/26
8.2K0
CNVkit的使用方法--肿瘤基因组测序数据分析专栏
使用CNVkit进行CNV分析
CNVkit是一款CNV预测软件,适用于全外显子,目的区域靶向测序等数据的CNV检测,官网如下
生信修炼手册
2019/12/19
7K0
使用CNVkit进行CNV分析
基于扩增子测序的新冠病毒测序引物设计
name pool seq length %gc tm (use 65) nCoV-2019_1_LEFT nCoV-2019_1 ACCAACCAACTTTCGATCTCTTGT 24 41.67 60.69 nCoV-2019_1_RIGHT nCoV-2019_1 CATCTTTAAGATGTTGACGTGCCTC 25 44 60.45 nCoV-2019_2_LEFT nCoV-2019_2 CTGTTTTACAGGTTCGCGACGT 22 50 61.67 nCoV-2019_2_RIGHT
用户7625144
2020/08/10
7330
MariaDB CentOS 安装的时候如何确定 Repo 地址
在CentOS 安装 MariaDB 数据库的时候,yum 安装显示没有匹配的安装包。
HoneyMoose
2020/05/06
8600
在不确定列号的情况下如何使用Vlookup查找
合计之外的每一个单元格 都需要引用 除了最基础的等于=引用 我们还有一种更加万能的Vlookup+Match的方法 这样无论日期怎么变化 无论日期顺序是否能对上 我们都不用更改公式
但老师
2022/03/22
2.7K0
在不确定列号的情况下如何使用Vlookup查找
react 在使用数据请求的时候和setState的时候哪个先处理
今天在工作中遇到一个问题,我司使用的是antd 组件,在使用react数据请求时,并在其中设置setState,页面发现了异常. 需求是这样的, 上面的调出项目为一个select选择,当时发生onCh
杭州前端工程师
2018/06/15
1.1K0
Illumina测序什么时候会测序到接头序列?
测序引物锚定在序列模板上,正好与模板的Rd2 SP (SP: sequence primer测序引物)完全互补配对,随后开始边合成边测序,所以测序reads 5'端的接头和引物序列都不会被测到,直接跳过。测序的第一个碱基是插入片段的第一个碱基。依次继续测。
生信宝典
2020/12/11
1.4K0
Illumina测序什么时候会测序到接头序列?
什么时候使用Dockerfiles(什么时候不使用……)
在这篇文章中,我们将讨论一些使用 Dockerfile 的最佳实践,探索一些注意事项,并使用 Dockerfile 和云原生 Buildpacks 构建应用。你将了解每种工具最擅长的工作是什么,以及如何决定何时使用它们。
CNCF
2021/12/15
1.8K0
什么时候使用Dockerfiles(什么时候不使用……)
如何确定您的企业需要使用在线CRM?
如果您是一个企业管理层,您可能已经听说过CRM,它的意思是客户关系管理。在线CRM是CRM系统的SAAS版本,无需安装任何软件,在网页上就可以将所有客户内容保存起来,简化您的工作方式,节省宝贵时间和金钱。但是您可能会想:“我为很么需要在线CRM,它对我有什么用?”很高兴你能有这个疑问,说明您开始思考在线CRM是否适合你,您可以通过以下方法确定您的企业是否需要CRM。
All in
2020/04/29
4290
为什么在开发的时候要避免使用 eval()函数
eval()是个功能很强大的函数,这同时也意味着通常你驾驭不了它。一般来说你用到这个函数说明你的设计在哪里出错了。
Hsinyan
2022/08/30
7190
为什么在开发的时候要避免使用 eval()函数
workflow04-用snakemake处理复杂命名
但通常来说,测序文件也会对应一些metadata。比如通过ENA 下载测序数据,就可以选择需要的信息:
北野茶缸子
2022/07/07
1.2K0
workflow04-用snakemake处理复杂命名
使用HashMap的时候小心点
我们都知道HashMap是线程不安全的,但是HashMap的使用频率在所有Map中确实属于比较高的。因为它可以满足我们大多数的场景了。
chengcheng222e
2021/11/04
3560
使用SimpleDateFormat的时候小心点
SimpleDateFormat是Java提供的一个格式化和解析日期的工具类,日常开发中应该经常会用到,但是由于它是线程不安全的,多线程公用一个SimpleDateFormat实例对日期进行解析或者格式化会导致程序出错。
chengcheng222e
2021/11/04
2750
使用DEseq2做转录组测序差异分析的时候顺便去除批次效应
昨天的讨论:TCGA等大样本量差异分析该使用DEseq2还是edgeR呢? 让大家印象深刻,也有不少留言问到如果转录组测序数据集有批次效应该怎么办。所以我打个补丁给大家,其实使用DEseq2做转录组测序差异分析的时候顺便去除批次效应。
生信技能树
2022/07/26
1.9K0
使用DEseq2做转录组测序差异分析的时候顺便去除批次效应
【已解决】springboot在使用redisTemplate的测试的时候报空指针
在使用springboot项目中,使用RedisTemplate在Junit测试的时候,报RedisTemplate空指针:
凯哥Java
2022/12/16
1.6K0
【已解决】springboot在使用redisTemplate的测试的时候报空指针
PHP foreach 遍历数组时候如何使用 list()
在 PHP 中,遍历一组非关联的多维数组,大部分代码是这样的: $items = array( array('var1', 'var2', 'var3'), array('var1', 'var2', 'var3'), array('var1', 'var2', 'var3'), array('var1', 'var2', 'var3'), array('var1', 'var2', 'var3'), ); foreach ($items as $item){
Denis
2023/04/14
1.1K0
学到的技术知识,在使用的时候总会忘记,如何将它们牢记与心?
遗忘是正常现象,再熟悉的编程语言如果一年半年不写也会变得生疏。他给出的建议是,与其牢记,不如理解和实践。
LIYI
2022/11/18
5050
WPF 在 DrawingContext 的 push 如何使用
如果在一个 DrawingContext 画出一个 DrawingVisual ,如何修改这个 DrawingVisual 的大小,对他进行变换?
林德熙
2022/08/04
4910
WPF 在 DrawingContext 的 push 如何使用
如果在一个 DrawingContext 画出一个 DrawingVisual ,如何修改这个 DrawingVisual 的大小,对他进行变换?
林德熙
2018/09/18
1.7K0
测序的时候是全外显子,分析的时候沦落到基因panel
虽然落脚点是肿瘤外显子的数据分析,但是掌握了这个系列里面的软件安装和数据库资源配置之后,处理普通的外显子数据也不在话下!
生信技能树
2021/10/22
1.1K0

相似问题

基因测序方面?

3364

利用r语言msm包跑数据的时候Q值如何确定?

0116

什么时候使用RSpec let()?

2629

什么时候在C#中使用线程池?

2847

如何使用case/Switch和GetType确定对象?

2451
相关问答用户
擅长3个领域
腾讯 | 技术专家擅长2个领域
高级数据分析师擅长5个领域
添加站长 进交流群

领取专属 10元无门槛券

AI混元助手 在线答疑

扫码加入开发者社群
关注 腾讯云开发者公众号

洞察 腾讯核心技术

剖析业界实践案例

扫码关注腾讯云开发者公众号
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档