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WorkBuddy + AutoDock Vina 分子对接实战:从蛋白准备到结果可视化,AI 助手全程辅助 作者:药学研究生 / WorkBuddy 养虾人
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WorkBuddy + AutoDock Vina 分子对接实战:从蛋白准备到结果可视化,AI 助手全程辅助 作者:药学研究生 / WorkBuddy 养虾人
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修改于 2026-04-27 12:48:17
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概述
分子对接是药物虚拟筛选和网络药理学的核心环节。传统的流程包括:蛋白预处理、活性位点确定、配体文件转换、对接参数配置、结果排序与可视化 —— 每一步都有大量重复操作和文件管理。
原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。
如有侵权,请联系
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目录
WorkBuddy + AutoDock Vina 分子对接实战
一、为什么用 AI 助手做分子对接?
二、环境准备
2.1 软件清单
2.2 工作目录结构
三、实战流程
Step 1:蛋白靶点准备
Step 2:配体准备
Step 3:确定活性口袋(对接盒子)
Step 4:编写对接配置
Step 5:运行对接
Step 6:结果分析
Step 7:PyMOL 可视化
四、实用 Prompt 合集
五、常见问题
六、参考资源
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