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Sentieon | RNA-seq 变异检测全流程详解

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INSVAST
发布2026-02-06 15:01:48
发布2026-02-06 15:01:48
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概述
Sentieon开发了涵盖比对、去重、RNA连接点处理及变异检测的一体化加速模块,通过高度优化的算法与工程实现,大幅缩短全流程分析时间,为高通量RNA-seq数据分析提供了高效、可靠的解决方案。
文章被收录于专栏:SentieonSentieon

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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目录
  • 一、前言
  • 二、Sentieon RNA-seq 流程总览
  • 三、分步详解
    • 1. 将读取序列比对到参考基因组
    • 2. 标记或去除重复序列
    • 3. 在连接点处分割读取序列
    • 4. 基础质量评分重新校准(BQSR;可选)
    • 5. RNA变异检测
    • 6. 质控
  • 四、实际运行测试
    • 1. 软件下载安装
    • 2. 测试该项目使用配置:
    • 3. 参考基因组下载
    • 4. gtf 文件下载
    • 5. SRP329754 fq数据下载
    • 6. 创建 index
    • 7. 分析运行
  • 五、分析结果展示
    • 1. 输出文件
    • 2. qc结果展示
    • 3. 用时统计
  • Sentieon软件介绍
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