作为一名经常需要处理复杂数据的科研人员,我一直在寻找一款操作简便又功能强大的多元统计分析工具。最近发现SIMCA这款软件真的很不错,特别适合需要进行PCA、OPLS-DA等分析的朋友。不少同行也在问我SIMCA下载和安装方面的问题,今天就分享一下SIMCA安装教程和全套流程,希望能帮到大家。
SIMCA最早是由瑞典Umetrics公司在80年代末开发的,经过这些年的发展,现在已经成为多元统计分析领域的强大工具。它不仅可以轻松处理多种文件格式,还能通过各种分析模块帮我们挖掘数据中隐藏的规律和趋势,让数据分析变得直观高效。
https://pan.quark.cn/s/01f0d331fa5c
开始安装SIMCA前,先关闭杀毒软件。
1、先把SIMCA压缩包解压出来。解压前一定要关掉杀毒软件,不然可能会误报。然后右击"SIMCA_14_1"文件夹,打开它。
2、在弹出的界面中点"Next"按钮继续。
3、勾选"I accept..."同意协议,然后点"Next"。
4、这一步直接点"Next"就行,不用改什么。
5、安装位置最好别改,就用默认的,直接点"Install"开始安装。选D盘安装也不错,能省点C盘空间。
6、等它安装,这个过程可能要几分钟,看电脑配置。
7、安装完成后点"Finish"结束安装向导。
8、装好后,在最近安装的软件列表里找到SIMCA 14.1,右键点击然后选择"发送到-桌面快捷方式",这样以后用起来方便些。
9、双击打开软件,会发现有30天使用期限的提示,别急,下面就解决这个问题。
10、先关掉软件,然后解压并打开"限制文件",复制里面的3个文件。
11、再到最近安装的软件中找到SIMCA 14.1,右键点击,选择"打开文件所在的位置"。
12、在打开的文件夹空白处粘贴刚才复制的那三个文件。
13、弹出替换提示时,都点击"继续"。
14、在这个文件夹里找到simca.14.1.x64-patch.exe文件,右键选择"以管理员身份运行"。
15、在弹出的窗口中点击"Patch"按钮。
16、出现OK提示后,点击"Exit"退出。
17、再次打开SIMCA软件,30天限制提示已经没有了,可以正常使用了。
如果你需要处理组学数据,还可以安装Omics插件,步骤如下:
1、在"科研宝典-SIMCA"文件夹中找到omics_skin压缩包并解压,打开解压后的文件夹,双击"Omics_skin_for_SIMCA_14.1_x64"文件。
2、点击"Next"继续。
3、安装完成后点击"Finish"。
4、在SIMCA软件中可以通过两种方式找到Omics插件。第一种:点击菜单栏的File-New-Omics project。
5、第二种方法:点击View-Omics。
在使用SIMCA进行多元统计分析时,新手常常会遇到一些问题。比如数据导入格式不对,或者不知道该选择哪种分析方法。其实这些都有简单的解决办法。数据导入时最好用Excel格式,确保第一行是变量名,第一列是样本名。至于分析方法,如果是探索性分析,建议先用PCA;如果是分类问题,可以尝试OPLS-DA;如果是相关性分析,O2PLS会是不错的选择。
分析完成后,记得查看模型的Q2和R2值,这两个指标能告诉你模型的预测能力和拟合度如何。一般来说,Q2>0.5就算是比较好的模型了。不满意的话可以试着调整参数或者预处理方法,比如尝试标准化或者正态化。
SIMCA的一大优势就是可视化效果好,但很多人没用好这一点。做完分析后,不要只看默认图表,试着调整一下图表样式和配色,能让你的结果更直观更美观。比如散点图可以按组别着色,热图可以调整颜色范围,柱状图可以添加误差线等。
另外,在导出图片时,建议用高分辨率PNG格式,这样放到论文里也不会模糊。如果需要进一步编辑,可以先导出为矢量格式(如EMF),然后在其他软件中精修。这样你的数据分析结果才能更好地展示出来,给审稿人留下好印象。
对了,最后提醒一点,做完分析一定要及时保存项目文件(.usp格式),这样下次可以直接打开继续分析,不用重头来过。用好SIMCA,让你的数据分析事半功倍!
原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。
如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。
如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。