一站式AlphaFold3在线算力服务已开放

近日，积算科技的一站式AlphaFold3在线算力服务已开放。其内置优化后的AlphaFold3模型，支持图形化界面创建容器、低代码启动任务，通过在线服务让科研人员绕开繁琐的部署、设置和调试，实现零门槛使用，以更简单、高效的方式完成蛋白质结构预测。

AlphaFold3一经发布就广受关注，它利用Transformer、扩散模型和进化信息多序列比对，不仅能高精度预测蛋白质结构，更能预测大部分生物分子的结构及其相互作用。与传统方法相比，在预测蛋白质与一些分子的"对接"方面精度提升高达50%，在药物研发、疾病机理研究、精准医学等领域应用广泛。

AlphaFold3计算过程高度复杂，涉及大规模MSA、深度特征提取、迭代结构预测及优化，对算力平台硬件配置要求高：GPU计算卡需要大容量显存和高带宽、计算节点大容量内存、数据存储容量超700G等。同时使用门槛高，在部署和使用过程中，往往需要通过命令行直接在操作系统界面进行操作，涉及数十句代码命令，需要操作人员具备一定的计算机编程基础。如果通过官方网站使用AlphaFold3，则存在每个账户每天限额20个任务、仅够试错2-3个靶点、输入长度限制等问题。

针对以上问题，积算科技在其算力服务平台正式上线AlphaFold3应用，为用户提供高效、易用的在线算力服务。用户开通服务后，无需部署即可在线使用AlphaFold3的全部功能，无需排队等待，支持最大5120AA（氨基酸，amino acid）的输入，并具有低代码操作、图形化容器搭建等特点，可大幅提升用户的使用体验。

积算科技算力服务平台支持图形化界面、低代码开发，极大地降低了使用门槛。用户远程登录平台后，通过图形化界面快速创建容器环境，只需要通过鼠标点击选择预置好的镜像、数据集及用户自行上传的输入序列，30秒内便可完成预测前的所有准备。之后，用户只需要进入容器，通过集成好的在线shell界面输入简单的两句代码，为AlphaFold3程序指定文件位置，回车运行即可体验强大算力带来的高水平运算速度。

支撑该算力服务平台的算力系统以高速InfiniBand计算网络为核心构建，配置全闪NVMe SSD共享存储，计算节点采用64核处理器核心、1TB大容量内存、8张GPU计算卡，显存容量超640G，为用户带来极高的性能体验，加速结果生成。此外，平台基于容器进行算力调度和资源管理，具备强大的平台管理、用户管理、资源管理等功能，帮助用户快速完成蛋白质结构预测。

积算科技秉承以客户为中心的服务理念，来自生物、医学、材料学、计算机等不同专业领域的团队成员紧密合作，从初期调研，到软件安装，再到作业测试，全程提供专业、可靠的技术解决方案。此外，积算科技撰写了AlphaFold3使用教程，帮助用户快速上手。

以740aa_4a5s.json为例，输出的结果存放在用户指定的文件夹。由于AlphaFold3并未集成结果可视化模块，待任务完成后，客户可将结果文件夹中的cif及json文件下载，使用pymol或paeViewer等工具进行可视化分析。

实测结果图如下（740aa_4a5s.json）：

结构配色方案：按子单位（左图）；结构配色方案：模型置信度（右图）

结构配色方案：按子单位（左图）；结构配色方案：模型置信度（右图）