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社区首页 >专栏 >用Claude code做生信分析竟然如此简单!(附保姆级使用教程)

用Claude code做生信分析竟然如此简单!(附保姆级使用教程)

作者头像
用户11203141
发布2025-08-04 08:35:42
发布2025-08-04 08:35:42
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代码可运行
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代码可运行

自Claude Code发布以来,不少用户表示已经放弃Cursor,转身投入Claude Code的怀抱,毕竟它的代码生成能力更强,对复杂任务的处理更稳定,用来搞科研也更香~

但目前仍有许多用户因为各种原因还没用上Claude Code,今天作者就手把手教你,如何在国内快速用上Claude Code,只需几步,轻松上手👇

“什么是Claude Code? Claude Code是Anthropic公司推出的AI编程工具套件,基于Claude 4系列大语言模型开发,能够通过自然语言指令在终端直接操作,拥有生成代码、修复Bug、分析数据、搭建生信流程等能力,支持原生集成至 VS Code、JetBrains等主流IDE,方便在本地开发环境中直接使用

注:Claude Code支持中文提问,直接输入您的需求就能生成或调试代码。由于Claude Code是命令行工具,建议使用者需要了解基本的Linux操作。

Claude code核心功能

模型支撑架构

  • 基于Claude Opus 4Sonnet 4双模型体系,结合性能与效率,实现更强的代码理解和生成能力。
  • Claude Opus 4在SWE-bench软件工程基准测试中,准确率达到72.5%,适合处理复杂的编码任务
  • Claude Sonnet 4在同等测试中准确率72.7%,与前代模型相比提升10.4%

核心能力突破

  • 持续工作能力:Claude Code可以连续稳定工作长达7小时,适合处理大型项目和复杂任务。
  • 扩展思维模式:Claude Code不仅能编写代码,还支持网络搜索外部工具调用(如代码分析器、运行器),能够主动查找资料、调用命令、进行辅助推理,形成“搜索—工具使用—代码修改”的闭环。
  • 项目记忆系统:Claude Code能够直接读取并引用本地文件,构建长期任务的记忆库,增强对话的上下文连贯性。它可以在交互中持续记住文件内容与逻辑关系,适合需要上下文保持一致的长期项目开发,或构建连接AI的个人知识库

无缝开发体验

  • IDE深度集成:与VS Code、JetBrains等主流开发环境原生兼容,融入你现有的工作流程。
  • 自动化工作流:通过GitHub Actions实现后台任务智能调度
  • 实时协作编程:提供类似结对编程的体验,在编辑器中实时显示代码建议与修改对比

Claude code国内使用困境

  • 订阅成本高:200美元/月(约1400人民币)的订阅费,价格较高
  • 需要魔法:为保持稳定的网络环境,需要魔法才能访问使用
  • 注册门槛高:需要海外的手机号/银行卡进行注册/支付

但好消息是,现在国内也有了无门槛接入Claude Code的新方式,更适合国内开发者日常使用与测试:

✅ 价格仅官方1/5,功能与官方完全一致

✅ 无需海外支付方式

✅ 国内直连,无需魔法

国内使用Claude code操作步骤

步骤1:注册/登录账号

登录:https://ai.dftianyi.com

打开浏览器登录网址(https://ai.dftianyi.com),选择Claude code(AICoder),点击“购买会员”自主选择套餐进行购买。

购买成功后,请耐心等待,待状态显示为“运行中”后,点击“查看 API KEY”按钮,即可获取密钥。

步骤2:安装Node.js

请确保系统中已安装 Node.js≥18.0。

Node.js安装地址:https://nodejs.org/en/download

步骤3:安装Claude code

操作系统:macOS 10.15+、Ubuntu 20.04+/Debian 10+、Windows 10(2004+)/Windows 11 硬件:最少4GB内存

(1)Mac/Linux

使用 npm 全局安装 AICoder-Claude工具

代码语言:javascript
代码运行次数:0
运行
复制
npm install -g @anthropic-ai/claude-code

(2)Windows

注:Windows系统更推荐使用WSL进行操作。

方法一(WSL):

1)以管理员身份运行PowerShell,启用Windows子系统功能和Windows的虚拟平台功能。

代码语言:javascript
代码运行次数:0
运行
复制
wsl --install

2)安装Linux系统

然后选择所需的Linux系统(例如Ubuntu):wsl --install Ubuntu

3)安装Claude code

安装Claude code:npm install -g @anthropic-ai/claude-code

方法二(git):

1)Windows以管理员身份运行powershell:

代码语言:javascript
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运行
复制
Set-ExecutionPolicy Bypass -Scope Process -Force#修复 npm 全局目录权限(选做)
代码语言:javascript
代码运行次数:0
运行
复制
npm install -g @anthropic-ai/claude-code

2)git:下载最新版的git

安装地址:https://git-scm.com/downloads

步骤4:配置API key

设置您的 API 密钥和服务端。

代码语言:javascript
代码运行次数:0
运行
复制
~/.claude/settings.json 或 .claude/settings.json

配置内容:

这里需要将 "your-api-key-here" 替换为您购买获得的实际 API key。

代码语言:javascript
代码运行次数:0
运行
复制
{
  "env": {
    "ANTHROPIC_API_KEY": "your-api-key-here",
    "ANTHROPIC_BASE_URL": "https://kjai.freeoai.com",
    "DISABLE_TELEMETRY": "1"
  },
  "permissions": {
    "allow": [],
    "deny": []
  },
  "apiKeyHelper": "echo 'your-api-key-here'"
}

步骤5:开始使用

在您的项目目录中运行claude命令。

代码语言:javascript
代码运行次数:0
运行
复制
claude

Claude code实操测试

作者这里用windows系统进行演示,进入claude code后,在对话框中输入提示词。

示例1:生成可视化图表

作者希望使用Claude code将数据转化为KEGG柱状图,直观展示基因在不同功能通路中的分布情况。

提示词:

使用XX文件生成KEGG柱状图,自动检测数据格式,输出代码和结果。

创建Todos
创建Todos

创建Todos

当检测到系统缺少必要的软件或环境导致无法运行时,Claude Code 会自动安装所需的软件包或配置环境。

好了,Claude Code运行结束,给出了非常完整的KEGG富集分析结果和可视化资源!

根据Claude Code给出的结果可以看到,KEGG功能分类的可视化图片展示了基因在不同功能通路上的分布情况。

示例2:数据统计分析

作者希望通过Claude Code对实验数据进行全面的统计分析,重点关注不同实验条件下的剂量-反应关系参数比较。

提示词:

批量读取XX文件中的CSV文件,自动识别数据集类型,检查数据完整性并合并为统一格式,对这个多类型剂量-反应数据进行统计分析:

  1. 计算每种数据集类型的描述性统计(EC50、Hill系数、响应范围等)
  2. 使用方差分析(ANOVA)比较不同类型间的参数差异
  3. 进行多重比较检验确定哪些参数在类型间存在显著差异
  4. 创建箱线图和散点图展示参数分布特征
  5. 分析激效现象的Alpha参数与其他参数的相关性

请确保所有统计检验结果包含p值、置信区间和效应量,并提供详细的统计学解释。

创建Todos
创建Todos

创建Todos

没几分钟,Claude code就创建了一个功能完善的剂量-反应数据统计分析脚本。

运行一下Python脚本,结果就出来啦!

实用建议:为了提高效率或优化流程,可以在项目根目录创建 Claude.md 文件,相当于给 AI 一份"项目说明书"。

关于我们 天意云致力于融合AI与海量算力,为生命科学领域提供一站式智能生信分析服务及解决方案。服务涵盖:

  • 生信分析: 宏基因组、单细胞、空间转录组等全方位分析。
  • 计算资源: 高性能生信专用服务器(共享/独享)、云端RStudio等。
  • AI工具与服务: 集成全球先进AI模型、科研AI翻译、私有化部署等。
  • 实验服务: 测序服务、靶向空间组学、检测试剂盒等。
  • 其他工具: 文献互助、云盘、PDF工具、学术网站建设等

平台背景 平台自2023年创建以来 已拥有6w+科研用户, 服务超过500+家高校、单位。 与华为云、移动云、易基因等知名企业达成战略合作,项目交付5000+

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已组建千人硕博科研交流社群

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原始发表:2025-08-04,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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目录
  • Claude code核心功能
    • 模型支撑架构
    • 核心能力突破
    • 无缝开发体验
  • Claude code国内使用困境
  • 国内使用Claude code操作步骤
    • 步骤1:注册/登录账号
    • 步骤2:安装Node.js
    • 步骤3:安装Claude code
    • 步骤4:配置API key
    • 步骤5:开始使用
  • Claude code实操测试
    • 示例1:生成可视化图表
    • 示例2:数据统计分析
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