细胞程序性死亡相关基因都一两千个了啊

上次看公众号总结的《The molecular machinery of regulated cell death》综述提到的细胞程序性死亡相关通路是12个，每个通路在每个癌症都有一个诊断模型，预后模型，分子分型的生物信息学数据挖掘文章！

最近刷到了2025年2月的文章居然又扩充到了16个通路的1571个基因：《Integrating bulk RNA-seq and scRNA-seq data to explore diverse cell death patterns and develop a programmed cell death-related relapse prediction model in pediatric B-ALL》，在线链接是：https://www.nature.com/articles/s41598-025-86148-y

提到了：A comprehensive collection of 1571 genes associated with PCD was compiled from GSEA gene sets, KEGG, and published literature

578 Apoptosis genes, 52 Pyroptosis genes, 88 Ferroptosis genes, 368 Autophagy genes, 101 Necroptosis genes, 14 Cuproptosis genes, 24 Disufidptosis genes, 9 Parthanatos genes, 15 Entotic cell death genes, 8 Netotic cell death genes, 220 Lysosome-dependent cell death genes, 7 Alkaliptosis genes, 5 Oxeiptosis genes, 24 Zinc-dependent cell death genes, 24 NETosis genes, and 34 Immunogenic cell death genes.

里面提到的1571 genes在文章里面没有给出来了，但是很容易查询到：

1. 凋亡（Apoptosis）基因： 包括AIFM1, AIMP1, BAD等。
2. 细胞焦亡（Pyroptosis）基因： 包括GSDMD, CASP1, NLRC4, AIM2, 和 IL18。此外，一项研究中提到了52个差异表达基因（DEGs）与细胞焦亡相关。
3. 铁死亡（Ferroptosis）基因：已确定的10个铁死亡相关基因包括UGT1A6, ATP6V1C1, MAFG, NUDCD1, PPP1R1A, TSKU, CTSB, AIFM2, CTSA, 和 CTNND2。另外，一项研究中提到了78个铁死亡相关基因。
4. 自噬（Autophagy）基因：在一项研究中提到了292个自噬相关基因，另外还有368个自噬基因。
5. 坏死性凋亡（Necroptosis）基因：提到了51个坏死性凋亡基因，另外还有101个坏死性凋亡基因。
6. 铜死亡（Cuproptosis）基因：14个铜死亡相关基因。
7. 二硫键凋亡（Disulfidptosis）基因：14个二硫键凋亡相关基因。
8. Parthanatos基因：9个Parthanatos相关基因。
9. Entotic cell death基因：15个Entotic cell death相关基因。
10. Netotic cell death基因：8个Netotic cell death相关基因。
11. 溶酶体依赖性细胞死亡（Lysosome-dependent cell death）基因：176个溶酶体依赖性细胞死亡相关基因，另外还有220个溶酶体依赖性细胞死亡基因。
12. Alkaliptosis基因：5个Alkaliptosis相关基因。
13. Oxeiptosis基因：5个Oxeiptosis相关基因。
14. 锌依赖性细胞死亡（Zinc-dependent cell death）基因：24个锌依赖性细胞死亡基因。
15. NETosis基因：24个NETosis相关基因。
16. 免疫原性细胞死亡（Immunogenic cell death）基因：36个免疫原性细胞死亡相关基因，另外还有34个免疫原性细胞死亡基因。

可以看到，不同来源的基因数量是有差别的， 而且每个基因列表，都可以独立的做一个数据挖掘课题！