文献分享--狭窄性克罗恩病的单细胞和空间转录组学突出了纤维化相关网络

作者，Evil Genius

从当下的情况来看，很多人失业，很多人忙着换工作，真的是旱的旱死涝的涝死，但是从最根本的情况来看，打铁还需自身硬。

今天我们分享文献

知识积累

纤维化是克罗恩病（Crohn’s disease, CD）的主要并发症，其特征是细胞外基质过度沉积，导致肠道狭窄和功能障碍。

纤维化是许多疾病的核心病理机制，最显著的是间质性肺纤维化，其中细胞外基质（ECM）沉积损害呼吸功能。

空间方法对于确定细胞相互作用发生的相关邻域至关重要。

结果1、stricturing CD的转录组图谱

结果2、单细胞转录组学中的组成差异

单细胞转录组学中的细胞类型特异性变化

结果3、IAF评分显示免疫和基质程序一致

以炎症性成纤维细胞这一关键疾病相关群体为切入点，证实免疫程序与内皮细胞程序均显著促进该细胞群的扩增，这一发现揭示了基质-免疫细胞间的重要互作机制及其对上皮细胞基因表达的深远影响。

结果4、A spatial atlas of stricturing CD

visium空间数据

单细胞空间联合分析注释visium。

visium解析内在的组织空间。

结果5、空间分布揭示肠细胞分区模式（空间轨迹）

结果6、肠纤维化的细胞邻近改变

肠道生理学基础的多细胞相互作用网络，基于的细胞类型的共现建立了细胞-细胞相互作用网络。

相互作用的细胞类型对中空间富集的配体-受体对（构成共定位的相互作用）。

结果7、CD中遗传风险模块的空间定位

通过空间定位90个全基因组关联研究（GWAS）鉴定的CD风险基因。

最后来看看方法

细胞共定位分析

空间配受体分析

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