顶刊分享--创伤后应激障碍患者大脑单细胞转录组学和染色质动力学研究

作者，Evil Genius

其实2年前就说过，现在是单细胞+时代。

今天我们分享文献

知识积累

创伤后应激障碍（PTSD）是一种多基因疾病，近年来的研究已开始对创伤后应激障碍的分子生物学机制进行深入的研究。

snRNA + snATAC + Spatial + GWAS。

人脑中的基因表达是由顺式调控元件（cis-regulatory elements，CREs）、染色质修饰以及转录因子与基因增强子和启动子的结合共同调控的，CREs在特定细胞类型中的作用对于理解疾病风险变异如何调控基因表达至关重要。

结果1、PTSD患者前额叶皮层单细胞多组学研究

单细胞的基础分析过程。

结果2、PTSD基因表达变化的空间验证

10X Xenium数据

结果3、创伤后应激障碍改变了神经元和小胶质细胞的通讯

CCC分析。

在创伤后应激障碍，可能是由突触传递的改变引起的神经元通信的差异。

结果4、PTSD转变基因表达的顺式调节

使用snATAC-seq测量染色质可及性，以确定创伤后应激障碍中细胞类型特异性顺式基因调节机制。

结果5、PTSD改变转录因子结合

结果6、PTSD风险位点的细胞类型特异性顺式调节

通过将细胞类型特异性ATAC数据纳入PIP评分并鉴定这些基因座中的TAD，鉴定了新的推定因果风险变体，并突出了额外功能基因组验证的候选者。

我们来关注一下Xenium的处理过程。

生活很好，有你更好