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python单细胞学习笔记-day1

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生信技能树
发布2025-01-11 21:20:09
发布2025-01-11 21:20:09
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前面,我们生信技能树的讲师小洁老师与萌老师新开了一个学习班:《掌握Python,解锁单细胞数据的无限可能》,身为技能树的一员,近水楼台先得月,学起!下面是我的学习笔记,希望可以给你带来一点参考

  • pip
  • conda

pip是 Python 的包管理工具,用于安装、升级和卸载 Python 软件包,常用于获取和管理 PyPI(Python Package lndex) 上的开源库。

pip 和conda是平行的两种安装途径,很多包/库可以用conda安装也可以用pip安装。

设置pip镜像

可以临时使用清湖镜像进行加速:https:./mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/help/pypi/

代码语言:javascript
复制
pip install -i https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/pypi/web/simple numpy

也可以进行默认设置:

代码语言:javascript
复制
python -m pip install -i 
https:./mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/pypi/web/simple -upgrade pip

查看环境从某个包的版本:

代码语言:javascript
复制
# 如果安装了则显示,没有安装不显示版本信息
conda list fastqc
03:30:58:Jupyter lab安装与使用
运行jupyter lab

ref:https://blog.csdn.net/Naisu_kun/article/details/130950884

代码语言:javascript
复制
conda create -n sc python=3.9 -y
conda activate sc

# 安装
pip install -i https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/pypi/web/simple jupyterlab 

# bash终端输入
jupyter lab

得到网页链接:http://127.0.0.1:8888/lab?token=2966f075203fc436e6f98292357608a87d18228e75d1bd3a

额 服务器上面的 访问不了,现在没有解决

我先使用 vscode的插件好了!

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自微信公众号。
原始发表:2025-01-10,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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