一、项目背景
医疗行业内的病理报告包含大量的文本数据,通常包含对不同人体部位的详细描述(如头颅、内脏等),每个部位可能涉及多个检查项目及结果。这些信息目前大多以非结构化的文本形式存在,不便于数据分析、统计和快速检索。为了提升病理信息的利用效率,客户希望能够将病理报告进行结构化处理,并通过关系图谱的形式展示,便于医生及研究人员更直观地获取关键信息。
二、项目目标
1. 信息抽取:使用NLP技术从病理报告中抽取出对应的人体部位信息及其描述项,例如:
患者:性别 -男 ,年龄 - 58
头颅:毛发分布 - 分布均匀,外形 - 无畸形
肝脏:大小 -正常,质地 -坚实,无硬结
鼻子:鼻腔 -通畅 ,鼻中隔 -居中
2. 数据结构化:将从文本中抽取出的信息进行结构化存储,形成标准化的数据格式(如JSON、数据库)。
3. 关系图谱展示:利用Echarts等可视化工具,将结构化信息以关系图谱的形式展示。不同的人体部位以节点表示,各节点之间的检查项目和描述以边进行连接,形成清晰的病理信息关系图谱。
4. 多条件检索:支持用户根据多个条件(如检查部位、结果描述等)进行检索,快速定位到特定的病理信息。
5. 图表互动功能:支持用户点击图谱中的节点或边,查看详细的病理描述,进行深度分析。
三、技术栈
1. 编程语言:Python(用于NLP算法)、JavaScript(用于前端展示)、Java(查询相关业务逻辑处理)
2. NLP框架:Python Transformers(HuggingFace)
3. 数据库:MySQL / MongoDB
4. 前端框架:Vue.js、Echarts
5. 数据接口:Flask / FastAPI(用于提供数据接口)
四、技术方案
1. NLP信息抽取
采用基于深度学习的NLP信息抽取技术,对医疗文本进行命名实体识别(NER)、关系抽取、情感分析等操作。
训练专用的医疗病理领域模型,提取特定人体部位及其相关属性信息。
可使用现有的开源NLP框架(如Spacy、BERT、RoBERTa)进行微调以适应医疗文本。
2. 数据存储
使用关系型数据库(如MySQL)或NoSQL数据库(如MongoDB)存储抽取后的结构化数据,确保数据检索的效率和灵活性。
数据结构设计以人体部位为基础,每个部位包含多个属性字段(如检查项目、结果描述等)。
3. 关系图谱可视化
利用Echarts库进行数据可视化,将结构化数据以图谱的形式呈现。
图谱节点表示不同的人体部位,边表示检查项目及描述信息。
关系图谱支持交互式操作,用户可以缩放、拖动、点击节点查看详细信息。
4. 多条件检索:
设计多条件检索接口,允许用户通过选择人体部位、检查项目、结果描述等进行过滤。
检索结果以高亮的方式在关系图谱中显示,方便用户定位。
五、预期成果
1. 数据结构化:病理报告中的关键信息能自动抽取并以结构化的形式存储,方便后续分析和展示。
2. 关系图谱可视化:通过直观的图谱展示,帮助用户更轻松地理解病理信息的分布及关联。
3. 快速检索功能:用户能够快速根据需求查询到目标信息,提高信息获取效率。
4. 数据统计分析:通过结构化数据,便于生成统计报告及进一步的病理数据分析。
原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。
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