基因表达芯片;
转录组;
单细胞;
突变、甲基化、拷贝数变异...
输入数据是数值型矩阵/数据框
颜色变化代表数据大小
散点图
箱线图:输入数据是一个连续型向量和一个有重复值的离散型向量
FC(Foldchange):处理组平均值/对照组平均值(除以)
log2Foldchange(logFC):Foldchange取log2
转录组和单细胞数据分析不需要取log
主成分分析,旨在利用降维的思维,把多指标转化为少数几个综合指标(即主成分)。
根据这些主成分对样本进行聚类,代表样本的点在坐标轴上距离越远,说明样本差异越大。
NCBI-GEO数据库
基因表达芯片的原理——探针的表达量代表基因的表达量
#intersect是取交集函数
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