下面是优秀实习生的整理和分享
推荐下面的。
正常。
你的无线网络访问清华镜像存在问题。
请查看群公告答疑文档,缺啥就安装啥。
不需要。
最好重新安装。
带4的就可以,4.3就绰绰有余了。
安装成功了,是正常的。
termius可以的
忽略提示。先从第一行开始,一行行run,每run一行观察左下角窗口的输出信息,没有关键词 error 且返回一个大于号 > 再run下一行
看图片中的红框。
没有关键词error就可以不用管。
成功了,很棒。
重新 run 提示关键词有 re-install ,指的是你已经成功安装 xx包,如果你是想要重新安装这个包,就需要加上 force = true 参数。不过一般我们不用重新安装的。
可以。
R和Rstudio记得要装在C盘,数据放在便携盘可以的。
可以。
卸载重装或者直接重装。
warning 的 信息可以不管。error提示的R包,需要重新安装一下。
没有提示信息就是没有问题的。有提示信息的,提示信息没有关键词error,就是成功啦
这些是代码,进行一些初始设置,比如前2行是设置镜像,因为默认是从R语言官网下载安装R包,可能会存在网络卡顿的问题。因此设置国内的清华镜像或者腾讯镜像,下载快一点。后面上课也会进一步介绍。
一般是设置成英文比较好,中文报错难搜索。你需要设置一下自己的系统语言为中文,然后重新安装R语言软件,安装时有一个messages translation,不勾选就是装英文的,勾选(默认)就是装中文的。
是的,可能是网络问题,导致你缺了某个依赖,单独安装你缺失的即可。比如这个报错,提示缺 GenomeInfoDbData ,那就单独安装一下这个包,方法是BiocManager::install('GenomeInfoDbData')
可以先忽略这个提示,后面会讲到。
通常不保存,不过具体还是要看自己的需求。
因为你的弹窗口了。
输出html即可。
工作目录不对。Rscript 和Rmd 运行 read.csv 的时候,需要保持工作目录一致。
忽略就行。
dll 报错,有可能是你开了杀毒软件,先关了杀毒软件,然后重启RStudio,再安装R包。
报错提示缺依赖包。
加载一下老鼠的注释包,然后改一下括号里面的orgdb。看看你是小鼠还是大鼠🐭,然后检索一下对应的包
都加 1,或者你上ppt里找负值那一页看看。
重启电脑,把杀毒软件关掉
KEGG的物种不对。
只要能登录服务器就行。
对的,基础功能就足够了~
如果你的代码提示框一直有个加号,说明你前面的代码没有运行完,一个代码,如果你不配对的括号或者配对的引号,它会无限制扩充到地球爆炸。因为他一直不配对,所以他认为你的代码一直没有输完,他也不会运行。exit之后把前面的全选运行一下就可以了。
可能是内存不足。
这个就是单行了哦,主要是你没有加上-N所以没有显示行号,如果有重复的行号 就说明有的行 一行没有显示完。
就是它就只有这么多内容,一页就显示完了,不需要任何翻动。你可以试试 less -S 单行显示,然后就可以左右翻页
你的bget在你的当前目录,不在$PATH记录的位置里,调用的话就得通过路径调用哦。所以你其实在bget前面加上路径就可以了, 比如 ./bget xxxxx 就可以了 你试试看哦
本身代码就是完整的,但是你多按了一下tab,系统认为你是要继续输入某些文件,所以给你匹配当前目录下的文件提示。
这是你家目录下的隐藏文件,隐藏文件需要用 ls -a 才会显示。类似的还有 .bashrc ,这在上课有讲。
tr这个命令接受的输入是标准输入,比较特殊,要用 tr 'a' 'A' < readme.txt
而且我在某个环境(比如rna)下,也可以用vim编辑该环境以外的文件,貌似也没有报错,我可以理解为:conda环境和文件编辑无关?所以有点疑惑“环境”到底是个什么概念呢?用ls -A miniconda3的时候也没有看到与环境相同名称的文件,难道他就是一个安装+归纳软件的虚拟空间?
conda的虚拟环境,就是一个安装+归纳软件的虚拟空间,这样理解就对了。
你在其他盘新建一个文件夹,如E:/Rlibrary,路径不要有中文,然后设置.libPaths(c("E:/Rlibrary","原来的的[2]")),然后把 [1] 里面的R包都拷贝到 E:/Rlibrary。