Day-3 Linux 系统下安装miniconda

miniconda 下载

搜索miniconda 清华 右键复制下载链接

安装miniconda

在服务器使用 wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 命令下载

成功安装miniconda

激活miniconda

使用命令 source ~/.bashrc

激活miniconda

miniconda环境配置

使用北外的镜像

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/

conda config --set show_channel_urls yes

miniconda环境配置

conda使用

查看服务器上安装的所有软件

conda list

查看软件

安装fastqc

conda install fastqc -y

fastqc安装成功

conda 新环境激活

conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y

conda info --envs

conda activate rna-seq

miniconda新环境激活

成功激活