DAY3-linux环境下的软件安装
原创DAY3-linux环境下的软件安装
原创
用户11039964
发布于 2024-03-24 22:56:22
发布于 2024-03-24 22:56:22
下载miniconda到服务器上
搜索miniconda清华进入清华的conda镜像网站miniconda清华
安装64位最新版本（latest）
登录服务器，进入biosoft目录
cd biosoft使用wget命令，wget + 刚才复制的链接
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh安装miniconda
运行：
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 
安装过程中的注意事项
生信星球
安装成功标志：
安装成功标志
生信星球
最后还需要激活,source ~/.bashrc来激活conda,注意空格
sourse ~命令行输入conda，出现满屏信息说明成功。
添加镜像
把下面代码全部复制到命令行
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes使用conda
查看当前服务器上安装的所有软件列表
conda list安装软件fastqc
conda install fastqc -y确认astqc软件是否安装成功
fastqc --help出现一大片文字，是软件的帮助文档，确定安装成功
原创声明：本文系作者授权腾讯云开发者社区发表，未经许可，不得转载。
如有侵权，请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
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