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R学习 R包

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guacamole
修改2024-03-10 18:09:46
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修改2024-03-10 18:09:46
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文章被收录于专栏:生信学习笔记

R包

多个函数的打包存放

相应的R包可实现特定的分析功能

R包包含函数、数据、帮助文件、描述文件

安装

R包来源有CRAN、Bioconductor、GitHub

代码语言:{r}
复制
install.packages(tidyr)#CRAN
BiocManager::install("limma")#Bioconductor
devtools::install_github("jmzeng1314/idmap1")
library("tidyr")#加载
devtools::install_local(“xxxx.zip”)#本地安装

安装后每次使用都要先加载,也可用来检验是否成功安装 载入包时回答提示信息尽量no*

已经安装的包,可直接调用其中的函数

代码语言:{r}
复制
pheatmap::pheatmap(volcano)#包名::函数名
library(pheatmap)
pheatmap(volcano)

学习R包的使用

代码语言:{r}
复制
browseVignettes("limma") #作者一手教程,不是每个包都有
ls("package:limma")#列出包中的函数等

引用自生信技能树 小洁老师

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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