生物技能树-R语言笔记Day1

第一天很兴奋🥰

心态很重要，提高效率

主要学习了R语言的基础，Rstudio的使用，R语言输出结果，R语言的数据和向量.

小洁老师好温柔呀

R语言基础= 数据➕函数

1. 重点不是函数的原理，而是我要使用的数据，数据是什么格式
2. 包，是一个函数的集合，一个工具

Rstudio

集成开发环境，可以让R语言变得更好用的图形界面

1. 如何在Rstuddio新建项目 （R project）
2. 如何新建脚本

脚本的名字不要.

脚本的运行方式：

• 光标放在哪一行，点Run，逐行运行
• 光标选中多行，Run运行
• #可以为脚本添加注释

3. 如何新建交互式会话 session

与R交互的两个方式：“控制台窗口”和“脚本编辑器”

（）前面的英文单词一定是一个函数，（）里是数据

4. 文件要放对位置：

新建project的时候，系统会自动给生成一个同名的文件夹工作目录，因此读取的文件，脚本，输出结果都会在默认的工作目录里，如果读取的文件在其他文件里，需要在脚本编辑器里特别提取

../ 可以读取上一级文件

二级文件里也可以读取

R语言在说什么？

1. 输出结果

可以是图片，文件，等等

2. Error

如何解决：检查命令，环境，然后修正

3.Warning

如果输出的结果没有意外情况，可以忽略

4. 没反应

如果出现> 表示已经运行完成

5. 控制台窗口出现一个红色圆点且长时间不动

重启

6. 出现+

上一句的代码运行不完整

在+后面补全信息即可，或者esc退出(光标要在+后面)，一定要处理

7. 出现提示信息

只要没有Error就可以忽略

8. 出现询问语句

一定要回答选择

数据类型及其组合

数据类型：

数值型numeric

字符型character 要加“”/‘’

逻辑型logica

1. TURE
2. FALSE
3. NA

数据类型的判断和转换

> class() #可以判断数据类型

> is.xxx() #判断是否为xxx类型

> as.xxx() #将其他数据类型转换为xxx类型

数据的运算

比较运算

>，<，>=，<=，==，!=

逻辑运算

与&，或｜，非！

向量

多个数据=向量（列）(需要是同一个类型的数据)

向量的生成

1.将元素放在一起

> c(2,3,4,5)
[1] 2 3 4 5

> c("a","b","c","f")
[1] "a" "b" "c" "f"

2.连续的数字用冒号：

> 1:5
[1] 1 2 3 4 5

3. 重复的用rep，规律的用seq，随机数勇敢rnorm

 rep("x",times=3)
 [1] "x" "x" "x"
 # x一定要加“”

> seq(from=3,to=21,by=4)
[1]  3  7 11 15 19

> rnorm(n=4)
[1] 0.93168482 0.03266106 0.98302102 0.87062830

4. 组合在一起变成更加复杂的向量

> paste0(rep("x", times=3), 1:3)
[1] "x1" "x2" "x3"

脚本乱码的解决方法 file>reopen with encoding>UTF-8>OK

课后思考：

paste0和paste有什么区别和联系？

load () 读取文件

sqrt() 开方

tab 作用, 可以出现提示，上下选择文件

光标放在>，点击向上建，可以修改上一条命令重新运行

生物技能树-2024生信入门3月学习班