文本处理三驾马车之Galaxy版awk

我们前面介绍了awk在Linux系统下的使用，见前文：

文本处理三驾马车之 awk

Galaxy 平台（UseGalaxy.cn）也整合了awk 工具，可以方便地对表格数据进行报表生成。

测试数据

• UseGalaxy.cn > 数据共享 > 数据库 > Table data > iris.tsv，选定数据
• 点击上方的 Add to History
• 选择 as Datasets。

操作

工具：Text reformatting with awk (Galaxy Version 1.1.2)

筛选文件中第一列大于5的行：

• File to process *：iris.tsv
• AWK Program：NR > 1 && $1 > 5

结果显示：

筛选文件中第一列大于5的行，并且保留表头（第一行）：

• File to process *：iris.tsv
• AWK Program：NR == 1 || $1 > 5

结果显示：

讨论

Galaxy平台只是整合了awk，为其提供界面化操作接口。至于awk命令的书写规范，跟其在Linux下的完全相同，如下图所示：