Day5-学习笔记（2024年2月2日）

R语言 数据结构

创建数据集

数据集就是由数据构成的一个矩形数组，行表示观测值，列表示变量。

PatientID是行/实例标识符，R中称为rownames（行名）

AdmDate是日期型变量，Age是连续型变量（定量型）

Diabates是名义变量，Status是顺序变量，二者都是分类变量，R中称为因子

一、向量

是用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组，可用函数c()来创建向量，eg：

a <- c(1, 2, 3, 6, -2, 4)#数值型

a <- c("one", "two", "three")#字符型

a <- c(TRUE, TRUE, FALSE, TRUE)#逻辑型

注意：单个向量中的数据必须拥有相同的类型或模式

标量是只含一个元素的向量，eg：a <- 3, g <- "US", h <- TRUE

在方括号中给定元素所在位置的数值，我们可以访问向量中的元素，eg:

①提取多个元素需用到**c()**，②冒号:用于生成一个数值序列

x <- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。

x <- 1:10 #从1-10之间所有的整数

x <- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）

x <- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

二、矩阵

矩阵是一个二维数组，只是每个元素都有相同的模式，可通过函数matrix()创建

先创建一个5x4的矩阵，再依次按行和列填充

三、数组

与矩阵相似，但是维度可以大于2，可通过函数array()创建

三维矩阵

四、数据框

由于不同的列可以包含不同模式的数据，数据框较矩阵更为常见，可用函数data.frame()创建

符号$用来选取给定数据集的某个特定变量，table()列联表

五、列表

列表是数据类型中最为复杂的一种，列表就是一些对象或成分的有序集合，可能包含若干向量、矩阵、数据框甚至其他列表，可用函数list()来创建。

mylist <- list(object1, object2,...)

header表示文件是否在第一行包含了变量名的逻辑型变量，sep#分来数据值的分隔符，默认sep=" ", 这表示一个或多个空格、制表符/、换行或回车

从向量中提取元素

1、根据元素位置

x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素

2、根据值

x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]#小于0的元素
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

实操

注意：需要读取的东西要先放在工作目录下（手动移动），否则会报错，无法读取

1、获取示例数据框

X<-read.csv('doudou.txt')

view(x)

2、读取本地数据框

read.table(file = "huahua.txt", sep = "\t",header=T)

2、查看行名和列名、行数和列数

colnames(a) #查看列名

rownames(a) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4..

dim(a)#几行几列

3、数据框的导出

write.table(a,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带有双引号）

重新保存的数据框

4、变量的保存和重新加载

#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量

save(a,file="test.RData")#保存其中一个变量

load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

5、提取元素

• ax,y#第x行第y列
• ax,#第x行
• a,y#第y列
• ay #也是第y列
• aa:b#第a列到第b列
• ac(a,b)#第a列和第b列
• a$列名#也可以提取列（支持Tab自动补全，不过只能提取一列） 6、直接使用数据框中的变量 iris是R语言的内置数据，可以直接使用。提取某两列作散点图： plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)
  

脚本的使用和保存：将上面的代码复制到一个新的R脚本中,

然后保存到工作目录下，再次打开，后缀是R。

问：save(a,file="test.RData")这句代码如果报错object a not found，是为什么？应该怎么解决？

答：可能是a这个变量不存在或者没有创建。