生信星球——生信入门DAY7:测序

今天的笔记是自己记的Goodnotes，字比较丑请见谅…………

关于测序的入门，零基础的非常推荐【陈巍学基因】视频1，讲的很清晰，可以对二代测序有一个最基本的了解。

分析软件可以选择fastqc，linux中可以直接用wget安装

`unzip fastqc_v0.11.7.zip`-->`cd FastQC`-- >`chmod755 fastqc`

chmod 用3个数字来表达对 用户（文件或目录的所有者），用户组（同组用户），其他用户 的权限： 　　如：chmod 755 fastqc

　　数字7是表达同时具有读，写，执行权限：(7 = 4 + 2+ 1) 　　读取--用数字4表示；

　　写入--用数字2表示； 　　执行--用数字1表示; 三者皆否：0

将FastQC文件夹导入环境变量

echo 'export PATH=/YOUR/FASTQC PATH/:$PATH' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc

最后依然是fastqc --help查看软件是否可用