作用就相当于App store,miniconda是conda的精华版,足够日常生信使用
进入上图的网址:https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
cd ~/biosoft
wget 刚才复制的miniconda下载链接
记住这里的粘贴不是ctrl+c和ctrl+V了,选中,鼠标左键点一下是复制,右键点一下是粘贴
运行
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
按指示一步步来,遇到yes/no就输入yes,然后按回车
source ~/.bashrc
conda
# 使用北外的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
像下图这样
conda list
如下图所示
conda install fastqc -y
ps:我觉得这个安装需要一点点时间,不是一下子就好了,当它停止于下图红色框框那行字时,不必管它
输入
fastqc --help
如果出现一大片文字,这是软件的帮助文档。因为只有安装成功的软件才能看到帮助文档,所以出现了这篇帮助文档,就可以确定已经安装成功。
原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。
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