Day7-测序知识

illumina测序技术

最后，以一些基础知识作为结尾吧~

多组学分类

基因组学（核酸序列分析）

1. 全基因组测序（WGS）
2. 全外显子组测序（WES）
3. 简化基因组测序(RRGS)

• 作用：基因组作图，核苷酸序列分析，基因定位，基因功能分析

转录组学（基因表达分析）

1. mRNA-Seq
2. IncRNA-Seq
3. sRNA-Seq

蛋白质组学

1. 蛋白质组数据处理、蛋白及其修饰鉴定
2. 构建蛋白质数据库、相关软件的开发和应用
3. 蛋白质结构功能预测
4. 蛋白质连锁图

代谢组学

1. 代谢物指纹分析
2. 代谢轮廓分析

测序发展历史

1. 第一代测序，桑格尔-双脱氧链终止法，特点：成本高
2. 第二代测序，主要代表illumina，特点：成本大大降低，提高测序速度，读长短，有一定错误率
3. 第三代测序，PacBio的纳米孔单分子测序技术，特点：read长，实现每一条DNA分子的单独测序，但是错误高（比二代高）