uname -a
wget 下载链接
开始下载miniconda软件包bash 安装包.sh
即bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
Thank you...miniconda3!
安装成功!source ~/.bashrc
镜像,相当于主网站(conda网站在国外)的副本,这样可以加快下载速度
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
引用自 生信星球
conda list
查看当前服务器上安装的软件列表conda install fastqc=0.11.7 -y
软件名称 --help
conda remove fastqc -y
:就是进行不同项目(转录组,基因组组装等等)分析的时候,需要不同的软件和同一软件的不同版本,需要进行conda环境分开互不干扰。
conda info --envs
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
意思是,-n是-name,新建名叫rna-seq的环境,指定python版本为3,并且安装软件fastqc、trimmomatic。conda activate rna-seq
,默认的*号就会转移到rna-seq那一行。conda deactivate
原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。
如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。
如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。