以下内容来自生信技能树学习
conda 软件包管理器
anaconda 自动安装了很多包
miniconda 下载器
1.通过miniconda 清华镜像uname -a务必通过此代码查看服务器位数查找适合自己的版本,注意区分X86_64与ppc64le的区别
注意区分Linux与Windows的区别
进入biosoft目录
用wget+链接
下载
如果失败 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
bash 上文所选择的版本
source ~/.bashrc
出现信息时,成功;反之继续运行添加镜像镜像,更快下载# 使用北外的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yesconda 使用conda list
查看当前服务器所安装列表安装软件
conda install 软件名 -y
-y 对安装过程中问题默认yes
指定版本号 conda install 软件名=版本号 -y
软件名 --help
查看文件帮助文档,可查看则为完成
conda remove 文件名 -y
conda info --envs
查看时,带*的就是当前激活的
创建环境
conda create -n 环境名 python=3 fastqc trimmomatic -y
指定python版本为python3,并安装 fastqc与trimmomatic
再次conda info --envs
查看conda activate rna-seq
此时输入fastqc,之前安装的文件,出现帮助文档,即为激活
conda deactivate
🥱🥱🥱
原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。
如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
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