测序的原理:边合成边测序(SBS)
#详细命令
```bash
# 进入到个人目录
cd ~
## 1.建立数据库目录:在数据库下建立参考基因组数据库,注意命名习惯:参考基因组版本信息
mkdir -p database/GRCh38.105 ##递归创建目录
## 2.建立项目分析目录
mkdir project
cd project
mkdir Human-16-Asthma-Trans # 注意项目命名习惯:物种-样本数-疾病-分析流程 使用英文、数字进行创建
cd Human-16-Asthma-Trans
# 建立数据存放目录
mkdir -p data/rawdata data/cleandata/trim_galore data/cleandata/fastp
# 建立比对目录
mkdir -p Mapping/Hisat2 Mapping/Subjunc
# 建立定量目录
mkdir -p Expression/featureCounts Expression/Salmon
# 查看整个分析目录准备结构
tree
├── data
│ ├── cleandata
│ ├── trim_galore
│ └── fastp
│ └── rawdata
├── Expression
│ ├── featureCounts
│ └── Salmon
└── Mapping
├── Hisat2
└── Subjunc
``
# 建立数据存放目录
mkdir -p data/rawdata data/cleandata/trim_galore data/cleandata/fastp
# 建立比对目录
mkdir -p Mapping/Hisat2 Mapping/Subjunc
# 建立定量目录
mkdir -p Expression/featureCounts Expression/Salmon
# 查看整个分析目录准备结构
tree
├── data
│ ├── cleandata
│ ├── trim_galore
│ └── fastp
│ └── rawdata
├── Expression
│ ├── featureCounts
│ └── Salmon
└── Mapping
├── Hisat2
└── Subjunc
原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。
如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。
如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。