Loading [MathJax]/jax/output/CommonHTML/config.js
前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
首页
学习
活动
专区
圈层
工具
MCP广场
社区首页 >专栏 >snapgene中文版怎么安装?snapgene安装使用详细图文教程

snapgene中文版怎么安装?snapgene安装使用详细图文教程

原创
作者头像
用户10519170
发布于 2023-04-20 07:03:00
发布于 2023-04-20 07:03:00
3.3K0
举报
文章被收录于专栏:MAC123MAC123

显示质粒图谱的酶切位点。右侧箭头可显示不同厂家出售的酶。显示质粒图谱的开放阅读框及转录方向。点击其显示的箭头可显示该ORF的片段大小、GC%值等一些信息。显示片段名称。显示编码的氨基酸序列,有缩写和全写两种。如多克隆位点。先找到质粒图谱中的多克隆

位点的第一个酶切位点和最后一个酶切位点。点击左侧sequence,找到两个酶切位点之间的序列。 右侧箭头,选择All 6 Frames,可得到编码序列的所有情况,其中代表的是终止密码子。更换方向。 

安装教程

软件最新激活版获取地址: yinyue8.top/?id=snapgene中文版

1、双击“snapgene_1.1.3_win.exe”开始安装

2、点击next设置开始菜单文件夹名称

3、设置软件安装目录,默认为“C:\Program Files (x86)\SnapGene”

4、点击install安装即可

使用教程

 一、 SnapGene中的几个View介绍

View1:Map

 1. 打开一个质粒图谱文件,在Topology option处选择circular。得如下界面:

  △给非编码序列命名:如多克隆位点。先找到质粒图谱中的多克隆位点的第一个酶切位点和最后一个酶切位点。点击左侧sequence ,找到两个酶切位点之间的序列。

View2:Sequence

点击Sequence,得到如下界面:

View3:

Enzymes 

 点击Enzymes,得到如下界面:

View4:Features

 点击Features,得到如下界面:

   显示各个已命名片段的一些特点。

二、 对片段进行注释

1.给编码序列命名:

点击其中一个箭头,按Feature→Add Translated Feature,弹出以下窗口:

Feature:给该片段命名。

Type:选择该片段的类型,右侧箭头代表阅读方向。

Color:选择颜色。

2. 给非编码序列命名:

3. 给质粒图谱增加引物序列:按Edit→Find,输入引物序列,找到质粒序列对应位置,点击Primers→Addprimer,弹出该界面:

按上下游引物选择TopStrand还是BottomStrand,在Primer处可给该引物命名,随后即可显示该引物在图谱Map中的位置。

三、 创建新DNA文件 

1. 打开SnapGene,点击New DNA File,弹出以下窗口:

在Create the following sequence窗口下输入DNA序列,并对该文件命名,点击OK。或是点击Import from Genebank,输入NCBI中某序列的access number,点击OK。

2.此时弹出如下窗口:

3.对该序列进行注释:点击Features→Add Feature,对该序列进行命名注释。

△创建质粒图谱文件方法相同。

四、处理序列翻译信息

1.创建一个DNA序列文件,点击

2.显示如下箭头:

 黄色箭头代表的是上面一条链编码序列,绿色箭头代表的是下面一条链编码序列。

3.点击Sequence,点击

4.添加内含子:根据内含子的位置,点击Edit→Select Range,输入内含子碱基位置。点击Features→Delete Feature Segment,得到如下图:

点击输入图片描述(最多30字)

紫色粗带为外显子,虚线为内含子部分。

五、引物、PCR和突变绘制

1.PCR引物绘制:在多克隆位点处找到合适的两个酶切位点。如BamHI和XbaI,在目的基因两侧截取15-30bp序列,点击Primers→Addprimers,选择top strand或bottom strand,如图:

给该引物命名,然后点击Insertion,在该引物上添加之前选择好的酶切位点序列,如图选择了BamHI,点解Insert:

 然后在该序列5端上添加数个碱基作为保护碱基。点击完成。

△下游引物设计相同,不再赘述。

2.突变引物绘制:在目的基因上截取一小段包含要突变位点的序列,点击Primers→Add primers,为该引物命名,在5’序列突变位点的三个碱基画黑,如图:

点击Insertions,选择突变成的氨基酸,点击Insert。即可获得该突变引物,点击Reverse Complement,可获得反向引物。

六、模拟标准限制性克隆

1.打开被插入片段的质粒图谱,选择合适的两个酶切位点,如HindIII和ApaI,如图:

点击Actions→Insert Fragment,点击HindIII+键盘Shift键+Apa,点击Insert,在source of fragment处选择插入的目的片段来源。点击上述同样的酶,给该重组质粒命名,点击clone。

七、 模拟融合克隆

1. 打开一个需要插入片段质粒图谱,点击Actions→Insert One Fragments,弹出以下窗口:

2. 点击sequence,找到想要发生替换的位点。 

3. 点击Fragment,在Source of Fragment处选择替换片段的另外一个质粒图谱。此时弹出另外一个质粒图谱图样。

4. 点击用于替换的片段,观察该片段阅读方向与被替换质粒位点的方向是否一致,如不一致,点击

5. 选择后,点击Product,点击Choose Overlapping PCR Primers,此时即形成融合后的质粒图谱。

6.若想获得引物的序列,点击Primers→Export Selected Primers,选择保存。

安装条件:

  1. 操作系统:Windows 7/8/10,MacOS 10.11及以上,Linux 64位系统。
  2. 处理器:Intel Core i3以上。
  3. 内存:4GB以上。
  4. 硬盘空间:至少需要1GB可用空间。

SnapGene的快捷键如下:

  1. Ctrl + N:新建文件。
  2. Ctrl + O:打开文件。
  3. Ctrl + S:保存文件。
  4. Ctrl + Shift + S:另存为。
  5. Ctrl + P:打印。
  6. Ctrl + Z:撤销。
  7. Ctrl + Y:重做。
  8. Ctrl + C:复制。
  9. Ctrl + X:剪切。
  10. Ctrl + V:粘贴。
  11. Ctrl + A:全选。
  12. Ctrl + F:查找。
  13. Ctrl + G:转到。
  14. Ctrl + E:显示/隐藏编辑器。
  15. Ctrl + T:旋转质粒图形。
  16. Ctrl + R:开启/关闭标尺。
  17. Ctrl + D:删除选中部分。
  18. Ctrl + B:反向互补序列。
  19. Ctrl + Shift + B:反向序列。
  20. Ctrl + H:查看帮助文档。

这些快捷键可以提高SnapGene软件的使用效率,减少用户的操作时间,更快地完成分子生物学设计和模拟任务。

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

评论
登录后参与评论
暂无评论
推荐阅读
编辑精选文章
换一批
snapgene中文版怎么安装?snapgene软件安装使用详细图文教程
SnapGene是一款生物信息学软件,用于DNA序列分析和基因工程设计。它具有直观的图形界面,易于使用,同时也提供了丰富的功能。下面我们来看看它的一些主要特点。
用户10436734
2023/03/31
2.4K0
snapgene中文版怎么安装?snapgene软件安装使用详细图文教程
分子生物学软件SnapGene 激活版下载安装,SnapGene软件下载激活
SnapGene是一款基于分子生物学的DNA序列编辑软件,广泛应用于生物学、生物技术、制药学等领域。本文将介绍SnapGene软件的基本概念、主要功能和使用方法,并通过实际操作进行举例说明。通过本文的介绍,读者可以更好地了解SnapGene软件的使用方法及其在不同领域的应用价值。
用户10413399
2023/04/14
4920
SnapGene软件教程,SnapGene分子克隆生物学软件的下载安装与应用
snapgene中文版是一款非常优秀且界面简洁的DNA序列分析软件。可以帮助用户方便的分析酶切位点、标签、启动子、终止子和复制子等质粒原件,生成详细的DNA序列文件。
用户10436734
2023/04/01
1.3K0
SnapGene软件教程,SnapGene分子克隆生物学软件的下载安装与应用
snapgene下载安装图文教程:snapgene怎么复制反向互补链
SnapGene是一款用于DNA序列管理和分析的软件,在生物医学领域中得到了广泛应用。SnapGene具有易于使用、操作简单、数据可视化等特点,可以帮助用户处理DNA序列信息,加快科研工作进程。
用户10515912
2023/04/26
8580
snapgene下载安装图文教程:snapgene怎么复制反向互补链
引物设计
PCR可以算得上是各生物实验室的标配技术了。无论是基因定量、克隆、组装、突变、测序……都离不开基于PCR的实验。目前,PCR相关试剂、耗材及仪器已经发展得相当成熟,包括聚合酶以及缓冲液的优化,使得扩增能力、保真度和兼容性均得到极大的提高。因此我们不再需要像过去一样,分散部分注意力用于摸索热循环条件、调整反应体系各底物的浓度等。也就是说,整个PCR实验条件,基本可以模板化,而不需每做一个实验都从头开始摸条件。 然而PCR实验中,有一个环节是厂家无法帮我们优化的,那便是引物设计。本文第一部分将以人EGFR基因为
用户1086810
2018/06/26
1.7K0
SnapGene软件下载,分子生物学分析软件SnapGene电脑版下载安装
SnapGene是一款广泛应用于分子生物学研究的专业软件,具备多种功能,如DNA序列编辑、PCR反应设计、限制性酶切图谱分析等。本文将介绍SnapGene软件的基本功能和使用方法,并结合具体案例分析SnapGene在分子生物学研究中的应用。
用户10413399
2023/04/13
4570
分子克隆软件SnapGene下载安装,生物学分析软件SnapGene下载安装
SnapGene软件是一种基于DNA序列分析的生物信息学工具,主要用于DNA序列编辑、分析、克隆等方面。该软件拥有直观的图形用户界面、强大的序列编辑和分析功能、多样化的文件格式支持等特点,可以帮助生物科学研究人员高效地开展相关工作。
用户10436734
2023/04/17
8520
🌟《生物代码革命:DNA存储与AI的奇妙反应》🌟
▸ 传统Bioinformatics:Needleman-Wunsch算法耗时严重
Jimaks
2025/03/31
2040
超全 | PCR引物设计-免费软件合辑
引物设计是PCR成功与否的关键因素之一。目前已经发表了上百种引物设计的软件,该如何选择这些PCR引物设计软件呢?此前《Bioinformatics》发表了一篇题为“Classification and review of free PCR primer design software”的综述文章,对目前可用的免费PCR引物设计软件进行分类和回顾性总结。
尐尐呅
2022/04/01
1.6K0
超全 | PCR引物设计-免费软件合辑
illumina、Sanger、第三代和第四代测序技术原理
1953年4月,Watson和Crick关于DNA双螺旋结构的文章发表于Nature,成为生物学研究的里程碑。此后,生命科学进入了DNA解密的时代。道德经所言“道生一,一生二,二生三,三生万物”,这“三生万物”需要的竟然仅仅是四种碱基的排列组合。生命的秘密藏在DNA序列中,首要任务,便是测出这序列内容。1970年,吴瑞先生建立了位置特异性引物延伸的测序方法,开了DNA测序技术的先河。随后在1975年,Sanger建立了自己的测序方法。1977年Gilbert等人建立了化学降解法,同年,Sanger改进了之前的方法,确立了日后第一代测序的主流方法:Sanger测序法。
DoubleHelix
2020/07/09
6.9K0
illumina、Sanger、第三代和第四代测序技术原理
全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) (1)
很多物种的转录本非常多样和复杂,绝大多数真核生物基因不符合“一基因一转录本”的模式,这些基因往往存在多种可变剪切(Alternative splicing,AS)形式。目前,基于第二代测序技术的RNA测序(RNA-seq)技术已被广泛用于各种转录组研究。但其测序的序列读长较短(50-300bp),大多只能覆盖转录本的一小部分,导致难以精确重构同一转录本的同源异构体(isoform),因此使得二代RNA测序对于全长转录本的重构是不准确的,片面的。
三代测序说
2024/01/23
11.7K0
全长转录组  |  Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio)   (1)
DNA序列分析软件SnapGene 5 mac中文版
SnapGene 5 for Mac是一款强大DNA序列分析软件,能够记录DNA构建体,而无需处理复杂的工具或工作流程。然后可以将数据导出为与设计用于DNA序列的其他流行软件解决方案兼容的文件格式。
Mac软件分享
2022/08/18
8210
DNA序列分析软件SnapGene 5 mac中文版
分子生物学研究 SnapGene软件安装包下载,SnapGene安装激活
SnapGene是一款专业的分子生物学软件,而且它是为了帮助学生、研究人员和制药公司设计、模拟和分析分子克隆实验而开发的。这个软件包含了各种功能,包括PCR、酶切、质粒、载体构建和电泳等等,在数据管理、编辑和共享方面具有很高的性价比。SnapGene通过可视化的方式帮助用户更好地理解和分析分子构造。
用户10413399
2023/04/19
1.2K0
从零开始学PCR技术(三):PCR引物设计
扩增子测序在临床基因检测中有广泛应用,合理的 Panel 设计非常重要,而 Panel 设计最终要落地,精心设计引物就是重中之重了。
简说基因
2020/12/02
1.2K0
从零开始学PCR技术(三):PCR引物设计
10X Genomics单细胞免疫组库VDJ分析必知必会
我们生活着的世界并非只有我们自己,而是有很多小于或大于我们的生物不断与我们交互着,有的让我们开心,有的使我们伤心。这就关系到一个本质的问题:
生信技能树jimmy
2020/05/29
7.7K0
10X Genomics单细胞免疫组库VDJ分析必知必会
致敬生命科学史上的伟大发明(一):Sanger测序
1981年,James W. Jorgenson和Krynn D. Lukacs发明了效率更高的毛细管电泳。
简说基因
2025/02/05
5060
致敬生命科学史上的伟大发明(一):Sanger测序
怎么安装SnapGene软件?分子生物学工具SnapGene激活版下载安装
在现代分子生物学研究中,序列分析、定位编辑、构建克隆等技术日益成为重要的一环。为了提高工作效率和数据处理准确性,需要使用专业的分子生物学工具。SnapGene软件就是一款常用的分子生物学工具,具有强大的序列分析、定位编辑、构建克隆等功能。本文将详细介绍SnapGene软件的特点和使用方法,并结合实际应用场景进行演示和说明。
用户10413399
2023/04/16
4720
一口气发布6篇Nature、15篇子刊,史上最大规模揭秘癌症复杂性:涵盖38种肿瘤的2658个癌症基因组
Nature的这6项研究来自全基因组泛癌分析(Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes, PCAWG)联盟,这是他们迄今为止最为全面的癌症基因组荟萃分析:
量子位
2020/03/04
7100
一口气发布6篇Nature、15篇子刊,史上最大规模揭秘癌症复杂性:涵盖38种肿瘤的2658个癌症基因组
Pacbio测序原理以及SMRT bell文库构建流程简述
2018年发的老文章了,文章不错,所以决定再捞一下。文中有3段视频,如需观看请大家移步“基因Share”观看。
bye
2021/01/21
2.4K0
常用分子生物学实验技术–整理「建议收藏」
        比如:我只需要长度300bp左右的分子。那么,电泳后,在切胶过程中,只切300bp处的分子即可。
全栈程序员站长
2022/09/07
2.5K0
常用分子生物学实验技术–整理「建议收藏」
推荐阅读
相关推荐
snapgene中文版怎么安装?snapgene软件安装使用详细图文教程
更多 >
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档