生信学习小组Day5笔记—Chocolate Ice
原创生信学习小组Day5笔记—Chocolate Ice
原创
Chocolate Ice
发布于 2023-01-14 10:03:41
发布于 2023-01-14 10:03:41
文章被收录于专栏：Chocolate Ice 学习笔记
R语言的数据类型与对象类型
- R的数据类型 主要有三种：
a = 1 #数字
b <- TRUE #逻辑
b = "abc" #字符串- R的对象类型 主要有六种
向量（vector）**
列表（list）
矩阵（matrix）
数组（array）
因子（factor)
数据框（data.frame)**向量与数据框是最重要最常用的两种对象类型。
图片来自https://www.runoob.com/r/r-data-types.html
向量
- 概念解释： 元素：指的是数字或者逻辑或者字符串 标量：一个元素组成的变量 向量：多个元素有序排列组成的变量（元素的数据类型必须统一，要么全是数字，要么全是字符串）
图片来自微信公众号：生信星球
- 从向量中提取元素
！！！提取子集的重要符号：
[](1）根据元素位置
x<-c(1:10) #x是一个由数字1到10组成的向量
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素（2）根据值
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素数据框
- 概念解释：数据框：相当于excel表格，由行和列组成。行列之间的数据类型可以不一样（矩阵内的每个元素都必须是一样的数据类型）
- 读取本地数据 在工作目录下新建文本文件（.txt），粘贴以下内容
X1 X2
A 1
B 2
C 4
D 3
E 7尝试使用
read.table()以及read.csv()读取数据
小贴士：默认从工作目录内提取文件，所以最好把数据保存在工作目录下，方便数据提取
- 设置行名列名
X<-read.csv('test.txt') #这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"name"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "test.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)
#最后row.names的意思是修改第一列为行名
#header=T的意思是第一行为表头
# sep=" "意思是指定字符的分隔符号为" "，在输入的时候，原内容是用什么符号分隔的，sep就要保持一致，否则可能无法正确读取。- 数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)
#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号） - 变量的保存与重新加载
save.image(file="nhanes.RData")#保存当前environmemt中所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令- 从数据框中提取元素
- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列（优秀写法，不过只能提取一列）课后问题
请在作业中回答一个问题：save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？
报错原因：没有X这个变量，可能是本来没有新建X这个变量，也可能是变量名字打错了（比如大小写）
解决方法：在environment中找找是否有这个变量，核查变量名输入是否正确
原创声明：本文系作者授权腾讯云开发者社区发表，未经许可，不得转载。
如有侵权，请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
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