忘了 vlookup 吧,我劝你用 dplyr 处理关系数据。
工作中经常有这样的需求,将两张表根据某些列合并起来。
有人喜欢用 Excel 的 vlookup 函数来处理。但对于生信人来说,这显然不够优雅,因为我们有更好的办法。
这就是 dplyr 包的 join 系列函数,主要有:
library(tidyverse)
library(kableExtra)
df1 = tibble(
A = c('a', 'b', 'c'),
B = c('x', 'y', 'z'),
)
kable(df1)
A | B |
---|---|
a | x |
b | y |
c | z |
df2 = tibble(
A = c('a', 'b', 'd'),
C = c(3, 2, 1))
kable(df2)
A | C |
---|---|
a | 3 |
b | 2 |
d | 1 |
在正式介绍连接之前,我们先讲一讲键
这个概念。
键:就是连接两个表所需要依赖的列。有时候,根据某一列,就可以把两个表连接起来,但也有可能需要根据几列才能完成连接。
左连接,就是左边的表不变,将右边的表附加到左边,不保留右表中多余的观测。
left_join(df1, df2, by = 'A') %>%
kable() %>%
kable_styling()
A | B | C |
---|---|---|
a | x | 3 |
b | y | 2 |
c | z | NA |
如果左表中的观测在右边的表中不存在,则合并后右表相应的位置标记为NA
。
右连接,就是右边的表不变,将左边的表附加到右边,不保留左表中多余的观察。
right_join(df1, df2, by = 'A') %>%
kable() %>%
kable_styling()
A | B | C |
---|---|---|
a | x | 3 |
b | y | 2 |
d | NA | 1 |
内连接,只保留在两个表中都存在的观测。
inner_join(df1, df2, by = 'A') %>%
kable() %>%
kable_styling()
A | B | C |
---|---|---|
a | x | 3 |
b | y | 2 |
全连接,保留在两个表中的所有观测。
full_join(df1, df2, by = 'A') %>%
kable() %>%
kable_styling()
A | B | C |
---|---|---|
a | x | 3 |
b | y | 2 |
c | z | NA |
d | NA | 1 |
过滤左表,只保留那些在右表中存在的观测。
semi_join(df1, df2, by = 'A') %>%
kable() %>%
kable_styling()
A | B |
---|---|
a | x |
b | y |
过滤左表,只保留那些不在右表中存在的观测。
anti_join(df1, df2, by = 'A') %>%
kable() %>%
kable_styling()
A | B |
---|---|
c | z |
本文简单介绍了 dplyr join 系列函数的功能,这些函数还有更加丰富的参数设置,可以参考 tidyverse 官方文档进一步学习。