2022年第一季度AI药物研发领域合作回顾
本文整理了2022年1月1日至3月31期间的21项AI药物研发领域的合作活动 (不完全统计，未公开的合作不包含在内)。
所达成的合作，反映了药企的具体需求，也体现了目前AI技术在制药行业多个环节中的现实价值和预期价值。
简要分析
从合作的数量来看，1月份达成的合作比较多，这或许与JP摩根医疗健康大会在1月份召开有关。
从合作涉及的治疗方式来看，目前的合作以小分子药物的发现和开发为主，另外涉及多种治疗方式 (如抗体、ADC、PROTAC等) 的合作项目也在增加。
从合作模式来看，除了常见的AI初创公司与制药公司的合作模式以外，药企内部开发AI，成为AI技术提供方，并与其他药企合作的模式开始出现。如天演药业将计算生物学和AI结合起来设计新型抗体、与Sanofi达成合作 (预付款1750万美元)，BMS部署了Roche开发的人工智能算法 (从临床试验样本中生成生物标志物数据)、来开发新的癌症治疗方法。
从合作的预付款来看，2022年Q1期间，AI技术方与制药行业的合作获得的预付款总额已经超过2亿美元，接近2021年Q1-Q4期间预付款总额2.43亿美元的水平，见下图。
2022年Q1期间的合作预付款及潜在里程碑付款 (不完全统计)
2021年Q1-Q4期间的合作预付款及潜在里程碑付款 (不完全统计)
合作活动整理
以下是2022年第一季度AI与制药行业的合作活动整理 (按时间顺序排列)。包含合作发布时间、AI技术方、制药行业方、简要合作信息。
具体合作信息如下。
2022年1月5日，专门从事AI新药设计的公司Iktos和专注于开发治疗难治性神经系统疾病的生物技术公司Astrogen宣布，两家公司已达成一项研究合作协议，旨在发现治疗帕金森病的临床前创新小分子候选药物。
根据协议条款，Iktos将应用其专有的基于主动学习的深度对接和基于新结构的生成模型技术来设计和优化新型化合物，并加快确定治疗帕金森病的临床前候选药物，靶点是一个未披露的靶点。Astrogen将为先导化合物/临床前候选药物的体外/体内药效筛选做出贡献，并将从临床前阶段开始领导整个开发过程。两家公司将共同负责产生先导化合物，并为选择临床前候选药物寻求最佳开发途径。
2022年1月5日，SRI International (SRI) 宣布，该公司已与强生旗下的杨森制药 (Janssen Pharmaceutica NV) 达成合作协议。根据协议条款，双方组织及其科学家将利用SRI的SynFiniTM平台 (一个Al驱动的自动化学合成系统) 进行小分子药物发现。
SRI的SynFini平台将人工智能和自动化相结合，以加速小分子药物的发现和开发。该平台由四个部分 (DASL™, SynRoute™, SynJet™和AutoSyn™) 组成，它们无缝协作，使分子的设计、分子的合成、筛选和优化 (reaction screening and optimization, RSO) 以及目标分子的产生自动化。
2021年1月6日，安进和Generate Biomedicines宣布了一项研究合作协议，以发现和开发跨越多个治疗领域和多种方式的5个临床靶点的蛋白质疗法。
作为研究合作的一部分，安进将为最初的5个项目支付5000万美元的预付款，潜在的交易价值为19亿美元，外加未来的特许权使用费，并可选择提名多达5个额外的项目，但需支付额外费用。对于每个项目，安进将支付高达3.7亿美元的未来里程碑和特许权使用费。安进还将参与Generate未来一轮的融资。其他条款未予披露。
2022年1月7日，利用深度学习人工智能和合成生物学扩大蛋白质疗法潜力的药物和靶点发现公司Absci Corporation (纳斯达克：ABSI) 宣布，它已经与默克公司 (在美国和加拿大以外称为默沙东) 达成了一项研究合作。合作将利用Absci的Deep Learning-Enabled Drug Creation™和Bionic Protein™技术。
根据这项合作，Absci将利用其Bionic Protein™非标准氨基酸技术，为默沙东的生物制造应用定制酶，并获得预付款和其他一些里程碑式的付款。此外，默沙东可以选择提名最多3个靶点并签订药物发现合作协议，Absci届时将有资格获得所有3个靶点的高达6.1亿美元的预付费用和里程碑付款，以及研究经费和销售的分阶段特许使用费。
2022年1月7日，赛诺菲和Exscientia宣布了一项突破性的研究合作和许可协议，利用Exscientia的端到端人工智能驱动平台，利用实际的患者样本，开发涵盖肿瘤学和免疫学的多达15种新型小分子候选药物。两家公司自2016年以来一直在合作，在2019年，赛诺菲获得了Exscientia的新型双特异性小分子候选药物的许可，该候选药物能够靶向炎症和免疫学中的两个不同靶点。
协议将利用Exscientia基于人工智能的能力和个性化医药平台 (从靶点识别到病人选择的整个过程)。研究将集中在肿瘤学和免疫学的多达15个新型小分子候选药物上。Exscientia将获得1亿美元的预付款，并有可能获得52亿美元的总里程碑付款和分阶段特许权使用费。
2022年1月11日，拥有人工智能/机器学习引导的抗体发现和开发平台的生物技术公司BigHat Biosciences宣布，已成功完成了与安进的先前未公开的第一阶段研究合作，并与安进达成许可协议，应用BigHat的平台对下一代抗体进行多目标优化。
BigHat的抗体设计平台将高速表征与AI/ML技术相结合，以设计具有更复杂功能和更好生物物理特性的抗体。这种方法降低了设计抗体和其他治疗性蛋白质以应对从慢性疾病到危及生命的疾病的难度。BigHat的实验平台极大地加速了候选药物的发现和验证。
BigHat支持AI的实验平台加快了抗体工程过程，以推进新型蛋白质疗法的设计和开发。
2022年1月11日，复星医药与端到端人工智能驱动的药物研发公司英矽智能 (Insilico Medicine) 共同宣布达成合作协议，在全球范围内共同推进多个靶点的AI药物研发。
这项战略合作包括针对四个指定靶点的以人工智能驱动的药物研发合作，以及双方对于英矽智能QPCTL项目的共同开发合作。根据协议，英矽智能将获得1300万美元的首付款、及里程碑式付款，并分享QPCTL项目的商业化利润。此外，复星医药将向英矽智能提供股权投资。
2022年1月11日，专门从事机器学习用于临床前药物发现的生物技术公司PostEra宣布扩大该公司与辉瑞的现有战略合作。扩大后的多靶点研究计划将建立一个人工智能实验室，PostEra和辉瑞在这里共同推进多个药物发现项目，最初的重点是肿瘤学和COVID-19抗病毒疗法。人工智能实验室将利用辉瑞的数据和PostEra在生成化学和合成设计方面的开拓性创新，为药物化学提供新型机器学习。
PostEra将获得1300万美元的预付款，如果所有的里程碑都能实现，则有资格获得总额高达2.48亿美元的额外里程碑付款，此外还有合作产生的任何获批产品的分阶段特许权使用费。
2022年1月14日，智能化和自动化技术驱动的药物研发公司晶泰科技宣布与致力于突破性创新生物偶联药物开发的生物医药公司启德医药达成项目合作，双方将联合推进新型抗体偶联药物 (antibody-drug conjugate, ADC) 项目的研发合作，希望共同打造临床优势明显的创新药物，为患者提供更为安全有效、更为可及的创新药物和治疗方案。
本次合作将聚焦在抗体偶联免疫激动剂 (antibody immune agonist conjugate ，AIAC) 药物的开发。抗体免疫激动剂偶联药物是ADC中最新的形式，其药物载荷 (payload) 为免疫激动剂。AIAC是通过特定的连接子技术把免疫激动剂与抗体进行偶联，旨在利用抗体的靶向性将免疫激动剂定向输送到肿瘤微环境中并局部释放，解决免疫激动剂全身给药的障碍，有助于抗肿瘤治疗的同时避免全身性的副作用。
2022年1月18日，晶泰科技宣布与正大天晴达成战略合作，双方将针对高难度靶点共同开发小分子新药，用于恶性肿瘤治疗。
晶泰科技与正大天晴的合作，是以人工智能为核心的新兴生物技术公司和集科研、生产和销售为一体的大型医药集团的强强联合。本次合作，晶泰科技将利用其人工智能和高精度计算化学等技术平台，完成化合物的生成、评估、优化等工作，聚焦小分子抗肿瘤创新药物的发现和优化。
2022年1月19日，Charles River和Valo Health宣布建立多年的战略合作伙伴关系，后者是一家利用人类数据和由人工智能驱动的计算来改变药物发现和开发流程的技术公司。
这项协议将把Valo的Opal计算平台与Charles River的药物发现和开发能力结合起来，提供一个新的变革性的、由人工智能驱动的药物发现和开发平台。
2022年1月24日消息，近日，未知君与奇辉生物共同宣布战略合作，双方将整合各自的技术与平台优势，在肠道菌群提取、纯化、临床应用以及AI制药等领域开展深度合作，并努力推动我国肠道菌群提取技术及微生态临床制剂技术的标准化质控和可监管性，促进肠道微生态产业有序、良性、健康发展。
CelerisTx和Merck KGaA
2022年2月9日，CelerisTx宣布与德国默克公司在早期药物发现领域达成一项研究合作协议，该协议使用CelerisTx基于图形的人工智能平台来发现和设计新型小分子粘合剂和双功能降解剂。CelerisTx的发现引擎结合了尖端的深度学习方法，例如几何深度学习、主动学习、处理过的降解信息的独特数据库，以及目前正在建设的用于闭环药物发现的机器人湿实验室设施。
2022年2月14日，人工智能和量子物理学驱动的下一代制药技术公司Aqemia宣布，它已经与杨森公司达成了一项试点研究协议。
Aqemia基于物理学计算预测小分子对特定靶点的效力的独特技术将被应用于选定的杨森的数据集。
该协议旨在建立对Aqemia技术性能的共同理解，以及如何最好地将其应用于不同类型的靶点蛋白质和疾病的药物发现项目。它包括来自杨森公司的预付款。
2022年2月16日，Unlearn宣布已与德国默克 (Merck KGaA) 达成多年合作，利用包括数字孪生 (Digital Twins) 在内的新型试验设计加速后期临床试验。最初，合作的重点是推进德国默克免疫学管线中候选药物的监管审批，并有可能扩展到其他治疗领域。
合作将利用人工智能生成的数字孪生来实现更小、更高效的关键性临床试验。
2022年2月16日消息，近日，德国默克公司和人工智能公司Quris签署了一项协议，默克将评估 Quris BioAI 机器学习平台，并将其与传统的体外和临床前动物试验进行比较。
默克 (Merck KGaA) 为其数字药物安全预测平台选择了新兴的人工智能开发商Quris，该平台是在用干细胞制成的小芯片包裹的微型人体组织 (器官芯片) 上进行的实验。
首先，默克公司将评估Quris的BioAI平台，并将其与传统的体外和临床前动物试验进行比较。该交易包括一个额外的选项，即默克公司可在未来获得涵盖某一特定疾病领域的独家授权，期限最长为五年，并与未披露的付款额挂钩。
2022年2月28日，翰森制药与深势科技达成合作。双方将充分结合翰森制药深厚的药物研发技术积淀，与深势科技Hermite Uni-FEP自由能微扰计算模块性能强大、高效准确的计算优势，共同推动翰森制药小分子的药物研发工作。
根据协议，深势科技将基于其一站式计算辅助药物设计平台Hermite，向翰森制药提供Uni-FEP自由能微扰计算支持，有望提升先导化合物优化阶段的研发效率。双方将在实际药物设计场景中，共同探讨如何将临床前药物研发与物理建模+AI的计算范式更广泛地结合。
Proteovant和Blueprint Medicines
2022年2月28日，Blueprint Medicines公司 (纳斯达克股票代码：BPMC) 和Proteovant Therapeutics公司宣布开展战略合作，推进新型靶向蛋白降解疗法，以解决重要领域的医疗需求。
根据协议，这两家公司将发现并推动最多两个新型蛋白质降解剂项目进入开发阶段，并可选择扩展到另外两个项目。Proteovant公司将获得2000万美元的预付款和高达6.32亿美元的里程碑付款以及来自Blueprint公司的分阶段使用费。
合作将利用Proteovant公司的人工智能增强的靶向蛋白降解平台和 Blueprint 公司的小分子精准医疗能力，满足肿瘤学和血液学方面的医疗需求。
2022年3月2日，致力于发现和开发基于抗体的疗法的公司天演药业 (Adagene，Nasdaq: ADAG)宣布与赛诺菲达成合作及独家许可协议，生成掩蔽单克隆 (masked monoclonal) 抗体和双特异性抗体，供赛诺菲公司开发和商业化。
根据协议条款，天演药业将负责早期研究，利用天演药业的SAFEbody技术，开发赛诺菲提供的新一代单克隆与双特异性抗体的精准掩蔽型安全抗体，赛诺菲将完全负责后期研究和所有临床、产品开发和商业化活动。
赛诺菲将向天演药业支付1750万美元的预付款，可首先启动两款赛诺菲提供的抗体候选药物进行合作开发，并有权提名额外的两款候选抗体进行开发与商业化。此外，天演药业将有资格获得高达25亿美元的潜在开发、监管和商业里程碑付款，这些候选药物将由赛诺菲独家开发和商业化。
2022年3月25日，罗氏宣布与百时美施贵宝合作，通过开发和部署两种新的数字病理学算法，来支持两种用于临床试验的检测方法的升级。
基于罗氏开发的人工智能算法 (从临床试验样本中生成生物标志物数据)，百时美施贵宝将能够开发出新的癌症治疗方法，使之能够根据患者的个人生物学特性进行个性化治疗。
Iktos和Ono Pharmaceutical
2022年3月30日，Ono Pharmaceutical宣布与Iktos达成合作协议，利用Iktos独特的人工智能药物发现技术开发新型小分子化合物。
根据协议条款，Iktos将应用其AI技术平台和专有技术，帮助基于全面的数据驱动的化学结构生成技术为药物发现过程带来新的见解和方向，以补充Ono的药物发现计划，以加快鉴定针对Ono Pharmaceutical选择的治疗靶点的新型小分子。Ono将获得在全球范围内开发和商业化合作中发现的小分子化合物的独家权利。Iktos将根据Ono的研究活动成果获得研究资金和里程碑付款。
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