Day4-学习笔记（2024年2月1日）

R语言基础

今日学习任务：1、安装R和Rstudio；2、认识R和Rstudio；3、学会外观设置和基本操作；4、完成第一个R做的图

看R for Data Science的第一章，系统学习作图

一、R软件和R包安装

B站链接：https://www.bilibili.com/video/BV1J44y1R7ci/?share_source=copy_web&vd_source=ba670d5a7ca081b044384f15866b88ef

百度网盘里的软件下载链接：https://pan.baidu.com/s/1YVf9lvI5jiK_7pPcdAQtvA 提取码：glgk

二、认识R和Rstudio

R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。

R语言软件界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。

RStudio是免费提供的开源集成开发环境（IDE）。RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。

Rsudio界面介绍

先做两个最简单的图

1、plot(rnorm(50))

rnorm 是R语言中用来生成正态分布随机数的函数，其中的参数 50 指定了生成随机数的数量。rnorm(50): 这部分代码生成了一个包含50个随机数的向量，这些随机数来自标准正态分布（均值为0，标准差为1）。

plot(...): plot 函数在R语言中用于绘制图形。当你将 rnorm(50) 生成的随机数作为参数传递给 plot 函数时，它会创建一个散点图，图中的点表示 rnorm 生成的随机数。在这种情况下，由于 plot 函数只接收到了一个向量，它会自动使用这些数值作为y轴的数据，而x轴数据则默认为这些数值的索引（1到50）。

总的来说，这串代码在R语言中用于生成一个由50个遵循标准正态分布的随机数构成的散点图。

50个标准正态分布的随机数构成的散点图

2、boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))

这段代码是用R语言中的boxplot函数绘制箱线图。iris是一个R语言自带的数据框，通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据。颜色参数col指定了每个种类对应的箱线图的颜色，分别为浅蓝色、浅黄色和浅粉色。因此，该代码的作用是创建一个箱线图，用以展示不同鸢尾花种类的萼片长度分布，并使用不同颜色来区分不同的种类。

小心得：作图说简单也简单，只需要知道图的名字，知道用的什么R包即可自行探索；说难也难，别人的代码套在自己的数据上，需要一定的R语言功底和解决报错的能力。

三、设置字体大小

示例

四、R语言基本操作

1、用Rproject管理工作目录

工作目录就是默认的读取和储存位置，也就是说，R语言只能和一个文件夹进行互动，这个文件夹非常重要，做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑，找不到。

查看这一篇【R-project管理多个R工作目录】养成好习惯：https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA

生信技能树的R语言视频链接：https://m.bilibili.com/video/av25643438.html

设置工作目录：setwd()

查看工作目录：getwd()

这样只设置了一个工作目录，但若有多个项目并行时，则需要多个工作目录，即多个文件夹。

（1）新建project

project是绑定文件夹的，给文件夹命名其实也就等于给project命名了，打开一个新的session不干扰目前正在进行的项目。

（2）打开project

在文件夹中找到这个R project，双击打开即可。

打开这个项目后，用getwd()查看一下，就会发现你的工作目录就是Rproject所在的目录啦，你用到的同一个项目的脚本/数据全都默认放在这里。

2、显示文件列表

dir()orlist.files()

3、基本运算

赋值<-或者按键Alt加上减号

x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x，赋值后，x会显示在右上角的框（Environment里的Value列表）

（1）四则运算：加+减-乘*除/

（2）整除运算：商%%，余数%/%

（3）指数运算：幂指数^，自然指数exp(1)##自然常数e

（4）对数运算：log2(), log10(), log()##以自然常数e为底, log(c,base=a)##a为底c的对数

（5）绝对值运算：abs()

（6）平方根运算：sqrt()

（7）三角函数运算（π用pi来表示）

三角函数采用弧度制，sin()，cos()，tan()，asin()，acos()和atan()分别表示正弦、余弦、正切、反正弦、反余弦和反正切

（8）判断正负：sign()

（9）比较运算：==等于, >大于, <小于, !=不等于, >=, <=

4、删除变量

a<-3
b <- 1
c <- 4
u <- 5+6
rm(b) #删除b
rm(u,c)  #删除u和c
rm(list = ls()) #清空所有变量

5、列出历史命令

history()相当于鼠标单击右上角的history标签

6、清空控制台

快捷键ctrl+l