推荐几个单细胞数据分享和展示平台 | 短视频演示

Broad的单细胞数据分享和展示平台

• 可选择子类展示
• 映射单个基因的颜色到t-SNE/UMAP图
• 分屏展示Cluster着色图和单基因着色图
• 多基因热图、Dotplot、Boxplot、Violinplot展示
• 部分图可导出矢量图格式

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视频2-4分钟，都没有声音，可直接播放

UCSC single cell browser

• 细胞t-SNE/Umap图可按metadata中很多属性着色
• 可查找定位关注的细胞、细胞簇
• 可着色单基因的表达图
• 可自定义颜色
• 可分屏展示2种颜色映射方式

http://mpvideo.qpic.cn/0b78uyaamaaavuaps72s2vqfbjwda2taabqa.f10002.mp4?dis_k=1165c909916ac5ecba220f81e04430fe&dis_t=1642508742&vid=wxv_1786097528107532289&format_id=10002&support_redirect=0&mmversion=false

视频2-4分钟，都没有声音，可直接播放

Cell X Gene

• 一个Python包，可部署到本地电脑或自己服务器展示
• 可按多种细胞属性着色
• 可绘制2个基因的表达相关性点图
• 可按单基因表达着色
• 可选择2个簇进行差异基因分析

http://mpvideo.qpic.cn/0bf25uabiaaaaiaoxiksyfqfb3odctwqafaa.f10002.mp4?dis_k=9af9a7df9ffb32af1990dd3a68a9b95a&dis_t=1642508742&vid=wxv_1786101356433342475&format_id=10002&support_redirect=0&mmversion=false

视频2-4分钟，都没有声音，可直接播放

ASAP在线单细胞分析平台

• 可在线进行单细胞分析
• 展示功能多出一个三维展示，其它无明显特色

http://mpvideo.qpic.cn/0bf2omabeaaalaabfgctyrqfa46dcjzqaeqa.f10002.mp4?dis_k=7efaf0998e149b93ae3d6daf63fa7351&dis_t=1642508742&vid=wxv_1786102363015970819&format_id=10002&support_redirect=0&mmversion=false

视频2-4分钟，都没有声音，可直接播放