基因表达热图聚类并增加行列注释

聚个类，可能模式更清晰一些。聚类参数有很多，如下图：按行聚类、按列聚类、行列聚类，聚类方法是什么，距离矩阵算法选哪个，我们提供了21种聚类算法，有通用的，有特异用于菌群数据的。

在我们打开聚类之前，这些参数都是禁用状态。这是一个特有设计。在ImageGP中很多依赖性参数都是这么设置的，主要用途就是避免选错、减少选择的慌乱性。参数很多，如果不可选，说明你用不上，也就忽略就好。

我们选择层级聚类Hierachical cluster行列聚类Column & Row，其它都默认。（选择聚类后，参数不再是灰色蒙版，而是可调了）

提交后获得结果

换一种距离计算算法，默认是Pearson，换成Spearman，换成欧式距离。

提交后获得结果（会对聚类模式有一些影响）

设置不同的距离矩阵和聚类方式可以尝试获得不同的聚类图。聚类热图怎么按自己的意愿调整分支的顺序？也可以帮你更精确控制聚类顺序（在不改变聚类层级结构的基础上）

增加列注释(也可同时或单独增加行注释)

数据格式和内容如下。

ID    conditions    individual    sizeFactor    SV1    SV2    SV3
untrt_N61311    untrt    N61311    1.021132476    -0.101    -0.494    -0.316
untrt_N052611    untrt    N052611    1.180398615    0.018    -0.170    0.588
untrt_N080611    untrt    N080611    1.179608275    -0.429    0.376    -0.089
untrt_N061011    untrt    N061011    0.923264178    0.535    0.241    -0.176
trt_N61311    trt    N61311    0.893927524    -0.125    -0.496    -0.366
trt_N052611    trt    N052611    0.670922884    0.036    -0.151    0.591
trt_N080611    trt    N080611    1.396766501    -0.467    0.441    -0.070
trt_N061011    trt    N061011    0.946230699    0.533    0.253    -0.162

既然是列注释，那么这个文件就得根表达矩阵的列名字有关系，不然怎么匹配起来呢？

先看一个错误的例子，我们把这个数据粘贴到行注释处 Paste row annotation matrix，看看有什么问题？

给我们弹出了一个提示错误：Paste main heatmap data to text area的第一列不等于Paste row annotation matrix (first column must match first column of data matrix)的第一列。是说数据不匹配。如果您以后也遇到同样问题，就要好好看下是不是粘贴错位置了。

没问题了，点击提交去看看结果

结果出来了，列注释加上了。不过图例没显示全，目前的策略只能是加大图片高度或下载PDF格式用Adobe Illustrator等软件修改。后续我们修复下，看是否可以多列显示图例。

测试数据获取：https://gitee.com/ct5869/bic