Leetcode 题目解析之 Repeated DNA Sequences
原创
Leetcode 题目解析之 Repeated DNA Sequences
原创
ruochen
发布于 2022-01-14 11:27:13
发布于 2022-01-14 11:27:13
All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACGAATTCCG". When studying DNA, it is sometimes useful to identify repeated sequences within the DNA.
Write a function to find all the 10-letter-long sequences (substrings) that occur more than once in a DNA molecule.
For example,
Given s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT",
Return:
"AAAAACCCCC", "CCCCCAAAAA".
考察位图。按位操作，A C G T分别用如下bits表示：
A 00
C 01
G 10
T 11所以10个连续的字符，只需要20位即可表示，而一个int（32位）就可以表示。定义变量hash，后20位表示字符串序列，其余位数置0 。
定义一个set用来存放已经出现过的hash，计算新hash时，如果已经出现过，就放入结果的set中。
public List<String> findRepeatedDnaSequences(String s) {
if (s == null || s.length() < 11) {
return new ArrayList<String>();
}
int hash = 0;
Set<Integer> appear = new HashSet<Integer>();
Set<String> set = new HashSet<String>();
Map<Character, Integer> map = new HashMap<Character, Integer>();
map.put('A', 0);
map.put('C', 1);
map.put('G', 2);
map.put('T', 3);
for (int i = 0; i < s.length(); i++) {
char c = s.charAt(i);
hash = (hash << 2) + map.get(c);
hash &= (1 << 20) - 1;
if (i >= 9) {
if (appear.contains(hash)) {
set.add(s.substring(i - 9, i + 1));
} else {
appear.add(hash);
}
}
}
return new ArrayList<String>(set);
}原创声明：本文系作者授权腾讯云开发者社区发表，未经许可，不得转载。
如有侵权，请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
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