前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
首页
学习
活动
专区
圈层
工具
MCP广场
社区首页 >专栏 >Annu. Rev. Immunol. |张泽民组综述单细胞技术解析肿瘤浸润免疫细胞新发现

Annu. Rev. Immunol. |张泽民组综述单细胞技术解析肿瘤浸润免疫细胞新发现

作者头像
生信交流平台
发布于 2022-09-21 08:11:35
发布于 2022-09-21 08:11:35
5300
举报

肿瘤微环境具有高度异质性,深入理解肿瘤微环境特别是肿瘤浸润免疫细胞的特征,对探究肿瘤发生发展和免疫疗法的关键调控分子至关重要。近年来,单细胞转录组技术成为解析肿瘤微环境的有力武器,在相关研究中取得了一系列突破进展,包括揭示肿瘤浸润免疫细胞的异质性、动态变化关系以及这些免疫细胞在不同肿瘤免疫治疗中的潜在功能。

近日,北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、北京大学生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)、北大-清华生命科学联合中心(CLS)张泽民教授受邀在免疫学顶级综述期刊Annual Reviews of Immunology上发表了题为Insights Gained from Single-Cell Analysis of Immune Cells in the Tumor Microenvironment的综述文章,系统总结了单细胞转录组技术在解析肿瘤微环境,包括浸润T细胞和髓系免疫细胞新特性的最近研究进展,以及其在揭示肿瘤免疫治疗机制上的应用和潜力,并对这一领域当前尚未解决的问题进行了展望。该综述是由北京大学副研究员任仙文,博士后张雷(现为深圳湾实验室特聘研究员)、张园园李子逸和百奥智汇Nathan Siemers张泽民教授共同完成。

该工作首先对单细胞转录组技术进行了总结,探讨了基于全长转录组SMART-seq2和基于微液滴5’或3’端RNA测序研究肿瘤微环境的优缺点,指出了单细胞转录组技术的快速发展对罕见免疫细胞类群的发现和复杂肿瘤微环境认知的推动作用。

随后,结合课题组在肝癌、肺癌和结直肠癌浸润T细胞的早期研究,该工作对近期国内外从单细胞转录组水平解析其他癌种包括黑色素瘤、乳腺癌、头颈癌等,浸润免疫细胞的最新研究进行了比较和总结。特别地,该工作总结了基于单细胞转录组数据,利用整合TCR信息(STARTRAC)、线粒体基因突变信息、RNA转录本动态变化(velocity)等开发的分析方法,在T细胞谱系追踪和动态变化刻画中的贡献,重点探讨了多项研究中保守存在的CD8耗竭T细胞(exhausted T cell)和调节性T细胞 (regulatory T cell, Treg)的特征和不同来源途径,强调了CD4 辅助性T细胞(Th cell)在肿瘤免疫研究中的前景。

另外,除T细胞外,髓系细胞(myeloid cell)也是肿瘤浸润免疫细胞的重要组成成分。该工作对肝癌、肺癌、结直肠癌、乳腺癌和脑胶质瘤等研究中的髓系细胞亚型,包括单核细胞(monocyte),树突状细胞(dendritic cell)和肿瘤相关巨噬细胞(tumor-associated macrophage, TAM)的异同进行了总结,特别是对课题组肝癌研究中发现的LAMP3+ DC细胞在不同癌肿中的来源和与T细胞的互作关系进行了比较。针对TAM细胞,该工作中指出更新巨噬细胞经典的M1/M2分型的重要性,对近期结直肠癌研究中发现的促进血管生成的SPP1+ TAM细胞亚群与其他癌种TAM细胞的异同进行了比较,突出了其在今后靶向TAM细胞治疗研究中的转化潜力。

最后,该工作总结了近期针对黑色素瘤、肺癌和肾癌等患者进行免疫检查点抑制剂(anti-PD1)治疗机制的研究,强调了CXCR5/TCF1+ CD8 T细胞对该治疗有效响应的重要性。随着单细胞组学技术如空间转录组等的发展,以及相关分析方法的开发,其将大大提高我们对肿瘤微环境和免疫治疗机制的认识,进而推进下一代治疗策略的开发。

北京大学生命科学学院副研究员任仙文,北大-清华生命科学联合中心博士后张雷(现深圳湾实验室肿瘤所特聘研究员)为并列第一作者,北京大学生命科学学院博士毕业生张园园(现北大-清华生命科学联合中心博士后)、李子逸(现上海交通大学医学院免疫学研究所博士后)和百奥智汇高级副总裁Nathan Siemers共同完成了本工作,北京大学BIOPIC和生命科学学院张泽民教授为通讯作者。此项工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金和北京未来基因诊断高精尖创新中心等支持和资助。

论文链接:

https://www.annualreviews.org/doi/pdf/10.1146/annurev-immunol-110519-071134

张泽民教授

张泽民,北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)与北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)研究员,北京大学生命科学学院讲席教授,长江学者,北大清华联合中心高级研究员。他的实验室目前正利用前沿的实验技术和生物信息学方法进行肿瘤及其微环境的异质性、耐药性、以及免疫细胞和肿瘤细胞的相互作用等方面的研究。2018年作为创始人建立百奥智汇科技有限公司,致力于挖掘单细胞基因组学和生物信息学在人类疾病诊断和治疗上的应用。

任仙文副研究员

任仙文,北京大学生物医学前沿创新中心副研究员,国家自然科学基金优秀青年项目获得者。从事单细胞转录组测序的生物信息学分析和计算免疫学研究,针对大规模单细胞测序数据的聚类、注释、时空重建等重要前沿生物信息学问题提出了关键技术创新,在Cell、Nature、Nature Medicine、Cell Research、Nature Communications等国际知名杂志上发表论文50多篇。

张雷研究员

张雷,深圳湾实验室肿瘤所特聘研究员,深圳市国家级领军人才获得者。博士毕业于北京大学分子医学研究所,2016年加入北大-清华生命科学联合中心/北京大学生物医学前沿创新中心张泽民课题组进行博士后研究。主要从事结直肠癌肿瘤微环境单细胞功能与组学技术应用研究,包括系统性地解析浸润T细胞和髓系细胞的特征及动态关系,揭示不同靶向髓系免疫治疗策略的潜在作用机理。成果以第一共同作者发表在Nature(2018)、Cell(“Best of 2020”)等杂志上。

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自微信公众号。
原始发表:2021-04-27,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 生信交流平台 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
暂无评论
推荐阅读
编辑精选文章
换一批
Windows平台下的SOCKS5代理配置与网络安全
本文将介绍在Windows平台下配置SOCKS5代理的方法,并探讨该代理协议在网络安全中的应用。通过正确配置SOCKS5代理,用户可以提高网络连接的安全性和隐私保护。
用户10616523
2023/06/14
3.3K0
Socks5代理技术保护亚马逊电商用户隐私
在亚马逊电商中,Socks5代理技术被广泛应用,它可以隐藏用户的真实IP地址、提高网络隐私和安全性、避免黑客攻击和网络钓鱼等安全威胁。亚马逊电商需要采取适当的安全措施,以保护用户的网络数据和隐私,同时也要加强对Socks5代理技术的管理和监控,以提供更好的网络服务和用户体验。
用户10616523
2023/07/03
2220
Socks5代理技术保护亚马逊电商用户隐私
Linux搭建Socks5代理服务器
原文地址:https://blog.ascv.cn/archives/62.html
傲绝
2023/03/08
4.9K0
Linux搭建Socks5代理服务器
Socks5代理的应用技巧
作为一名专业的爬虫程序员,我知道在进行数据采集时,使用代理服务器是很常见的。今天,我想和大家分享一些关于Socks5代理的应用技巧,希望能够帮助大家更好地利用Socks5代理来提升爬取效果。
华科云商小彭
2023/08/11
4880
Socks5代理的应用技巧
介绍几个socks5代理IP工具
Socks5代理IP是什么?很多小伙伴对于这个都不是很熟悉,下面小编将给大家具体介绍下socks5是什么,并介绍几个socks5代理工具。
互联网的鱼
2023/04/23
9.8K0
Socks5如何突破反爬限制
大家好!今天我要和大家分享一个关于反爬虫限制的话题,以及如何利用Socks5来突破这些限制。在进行网站数据采集时,可能会遇到一些阻碍,比如被网站限制或频繁触发反爬虫机制。而使用Socks5可以是规避这些限制最有效的方法。让我们一起来了解一下吧!
华科云商小彭
2023/09/13
2260
Socks5如何突破反爬限制
Socks5代理在多线程爬虫中的应用
在进行爬虫开发过程中,我们常常需要处理大量的数据,并执行多任务并发操作。然而,频繁的请求可能会引起目标网站的反爬机制,导致IP封禁或限制访问。为了规避这些限制,我们可以借助Socks5代理的强大功能,通过多线程爬虫来实现高效而稳定的数据获取。本文将为您详细介绍Socks5代理在多线程爬虫中的应用,带您解锁数据获取的新姿势。
用户614136809
2023/08/16
2090
解析Socks5代理服务的功能与链接速度分析
用户10616523
2023/06/15
2500
IP代理和Socks5代理技术在知识产权保护中的双重性
本文从IP代理、Socks5代理技术和知识产权保护等角度出发,探讨了这两种技术在知识产权保护中的双重性,同时提出了一些保护知识产权的措施,包括合法使用代理技术、加强网络安全管理、建立专门的知识产权保护机制和加强知识产权意识等。
用户10616523
2023/07/03
1770
IP代理和Socks5代理技术在知识产权保护中的双重性
http,socks5,socks4代理的区别[通俗易懂]
HTTP代理:能够代理客户机的HTTP访问,主要是代理浏览器访问网页,它的端口一般为80、8080、3128等; SOCKS代理:SOCKS代理与其他类型的代理不同,它只是简单地传递数据包,而并不关心是何种应用协议,既可以是HTTP请求,所以SOCKS代理服务器比其他类型的代理服务器速度要快得多。
全栈程序员站长
2022/07/02
4.9K0
红队第9篇:给任意java程序挂Socks5代理方法
在内网横向过程中,经常会用frp、狗洞、nps等工具,在内网环境中搭建一个反向socks5代理,方便红队人员开展内网渗透工作。于是,红对人员需要对各种渗透工具挂上Socks5代理,使用proxifier这个工具挂全局s5代理是非常方便的,但是有的渗透工具是使用java写的,而且作者并没有编写Socks5代理功能,用proxifier挂java.exe进程的时候总会出现各种各样的问题,这种情况下可以用java自带的命令行功能解决。
ABC_123
2022/07/01
3.4K0
红队第9篇:给任意java程序挂Socks5代理方法
代理IP、Socks5代理和SK5代理的不同应用场景和用途
代理IP、Socks5代理和SK5代理是在网络通信中常用的代理技术,它们在不同的应用场景和用途中发挥着关键作用。本文将探讨这些技术的具体应用场景,以帮助读者了解何时使用代理IP、Socks5代理或SK5代理,并选择适合其需求的代理解决方案。
用户10616523
2023/07/12
3050
网络协议之:还在用HTTP代理?弱爆了!快试试SOCKS5
存在即是合理,SOCKS5的出现是为了解决SOCKS4中不支持身份认证的大问题而出现的,毕竟大家对网络中的安全越来越重视了。没有认证的网络就好像是生活在摄像头下的人生,毫无隐私可言,实在是太可怕了。
程序那些事
2021/12/09
1.3K0
通过SOCKS代理渗透整个内网
经过前期的渗透工作,我们现在已经成功找到了web站点的漏洞,并且获得了一个普通的webshell,现在准备用菜刀去连接它。
全栈程序员站长
2022/07/05
1.7K0
通过SOCKS代理渗透整个内网
代理IP、Socks5代理和SK5代理的技术解析
代理IP、Socks5代理和SK5代理是在网络通信中常见的技术手段,它们在保护用户隐私、提高网络安全性和实现匿名访问等方面发挥着重要作用。本文将深入探讨这些技术的原理、特点以及应用领域,帮助读者更好地理解代理IP、Socks5代理和SK5代理的工作原理和使用场景。
用户10616523
2023/07/12
1.7K0
代理IP、Socks5代理和SK5代理的技术解析
什么是SOCKS5代理
SOCKS5是一种网络传输协议,它可以在不暴露用户真实IP地址的情况下提供数据传输服务。与其他代理协议相比,它具有更高的安全性和更好的性能。
用户10616523
2023/06/15
3830
结合Socks5代理和HTTP协议的爬虫系统
步骤1:选择合适的编程语言和开发环境。常用的爬虫开发语言包括Python、Java和Node.js等。
用户10616523
2023/06/19
2970
什么是SOCKS5代理?
SOCKS代表SOCKet Secure,也是一种互联网协议,常用于内容流媒体播放或P2P共享等流量密集型活动。SOCKS通过传输控制协议(TCP)连接,这种连接专门用于通过互联网发送和接收数据包,并确保能通过网络成功传输资源。
用户7850017
2022/07/29
6660
什么是SOCKS5代理?
Socks5代理 vs. Socks4代理:特点和区别解析
在网络通信中,使用代理服务器可以提供更安全、匿名的连接。其中,Socks5和Socks4是两种常见的代理协议。本文将深入探讨它们之间的特点和区别,帮助您选择适合自己需求的代理类型。
用户614136809
2023/08/30
7080
Socks5隧道实现高效采集
在当今信息爆炸的时代,数据对于个人和企业来说变得尤为宝贵。然而,当我们需要采集大量的数据时,如何才能高效、稳定地获得目标网站的信息呢?本文将为大家分享使用Socks5代理的技巧和方法,帮助你轻松地进行数据采集。
华科云商小孙
2023/08/11
2500
推荐阅读
相关推荐
Windows平台下的SOCKS5代理配置与网络安全
更多 >
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档