【科研小工具】输入任意坐标即可显示相应脑区详细解剖信息

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在标准的大脑坐标体系统中（如Talairach坐标系统），每一个3维坐标都对应着大脑的一个区域位置，那么，给你一个任意的3维坐标，如何快速知道这个坐标对应的脑区详细解剖信息？不用怕，这次就给各位推荐一款方便好用的小工具—Talairach Client，其可以很好地解决上述的问题，即输入任意坐标即可显示相应脑区详细解剖信息。

什么是Talairach Client

Talairach Client是德克萨斯大学圣安东尼奥健康科学中心的影像研究所开发的一款小软件，其可以实现Talairach系统脑图谱的定位。简单来说，对于任意输入的3维坐标，Talairach Client可以给出这个坐标对应的5个level脑区解剖信息，即属于哪个半球（hemisphere）, 属于哪个脑叶（lobe）, 哪个脑回（gyrus）, 脑组织类型（tissuetype）, 脑细胞类型（celltype），如下所示：

Left Cerebrum, Temporal Lobe, Inferior Temporal Gyrus,Gray Matter, Brodmann area 20

下载与安装Talairach Client

1. 打开网址：http://www.talairach.org/manual.html
2. 点击网页中的“Download PC”即可下载，如图1所示。

图1

1. 解压压缩包，得到如图2所示的文件；直接按住鼠标左键把“TalairachClient”整个文件夹拖进“Shortcut to Program Files”，即可自行安装；然后把“Shortcut to TalairachClient”快捷方式拖拉到桌面，便于使用，如图3所示。

注意：如果你的电脑里面没有安装Java，当你点击如图3所示的快捷图标时，会提示你安装Java，大家根据提示进行Java的安装，安装后重启电脑即可。

图2

图3

Talairach Client如何使用

安装完成之后，点击图3所示的快捷方式即可启动Talairach Client。Talairach Client提供了3种搜索方式，即single point, nearest gray matter和cube range，如图4所示。

图4

1. single point：single point指的是输入任意坐标，即可显示出这个坐标对应的脑区信息。比如说，我们输入3维坐标（-20,15,5），得到的结果如下：

Label at(-20, 15, 5):

LeftCerebrum, Sub-lobar, Lentiform Nucleus, Gray Matter, Putamen

具体设置如图5所示。

图5

1. cube range：cube range指的是以输入的坐标为中心，形成一个一定大小的立方体，以这个立方体作为搜索范围，来寻找这个立方体内的脑区信息。这个立方体的大小可以在软件中进行设置，从+/- 1mm到+/-5mm。例如，输入坐标(45, 15, 10)，cube range设置为+/- 2mm，结果如下：

Labels within2 mm of (45, 15, 10):

39: RightCerebrum, Frontal Lobe, Inferior Frontal Gyrus, White Matter, *

30: RightCerebrum, Frontal Lobe, Precentral Gyrus, Gray Matter, Brodmann area 44

27: RightCerebrum, Frontal Lobe, Inferior Frontal Gyrus, Gray Matter, Brodmann area 44

18: RightCerebrum, Frontal Lobe, Precentral Gyrus, White Matter, *

9: RightCerebrum, Sub-lobar, Insula, White Matter, *

2: RightCerebrum, Frontal Lobe, Precentral Gyrus, *, *

具体设置如图6所示。

图6

1. nearest gray matter：这个指的是寻找离输入坐标最近的gray matter label。比如说，输入坐标(45, 15, 10)，结果如下：

Gray Matternearest to (45, 15, 10):

RightCerebrum, Frontal Lobe, Inferior Frontal Gyrus, Gray Matter, Brodmann area 44,Range=1

具体设置如图7所示。

图7

总结

本文，给大家推荐了一款名为Talairach Client的小工具，其可以实现输入任意坐标即可显示相应脑区详细解剖信息的功能，希望对大家的研究有所帮助。这款软件的缺点是，只能输入Talairach坐标，而不能输入MNI坐标；如有需要可以先把MNI坐标转换成Talairach坐标，然后再使用这款软件查找脑区信息。