前往小程序,Get更优阅读体验!
立即前往
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
社区首页 >专栏 >如何利用ImageJ进行荧光强度测量?

如何利用ImageJ进行荧光强度测量?

作者头像
百味科研芝士
发布2020-09-22 16:10:07
27.7K0
发布2020-09-22 16:10:07
举报
文章被收录于专栏:百味科研芝士

导言

ImageJ是一个很强大的图片处理工具,那么对于我们平时拍的带有荧光色彩的图片,想要测量荧光的强度用来进行定量描述,这些都可以用ImageJ来进行完成,如下图所示,我们可以对其进行荧光强度测定。

软件

FIJI

图文教程

1. 这里我们使用软件内置的图片进行教程的素材,选择荧光细胞的图片进行接下来的分析。

2. 首先将图片进行拆分成单通道的图片才可以进行测量,先点击更改通道。

3. 然后点击拆分通道

4. 就会出现三个通道的图片

5. 我们选中第一个图片C1,选择阈值

6. 选择默认值,勾选Dark background,如果觉得没选中或者选的不好,可以调节上下两个滑动的按钮进行选择,或者选择其他算法。

7. 此时图中的荧光就会被选中。

8. 接下来我们选择要测量的指标,选择Analyze里面的设置测量参数。

9. 勾选平均密度值,限定到阈值,展示标签即可。因为我们所测量的面积,是通过threshold产生,以此来确定我们所需要的测量的选区,所以需要勾选Limited To Threshold,同时有C1,C2,C3多张图片在测量,所以把Display Label也勾选上,以此进行区别。

10. 然后,我们点击一下测量,看看结果。或者直接按快捷键Ctrl+M,即可进行测量,此时就会出现我们需要的C1区的荧光强度。

11. 同理,我们进行C2和C3的测量,得到结果。

12. 所以,这张图片的荧光强度就是C1,C2和C3的总和,直接相加进行作图即可。怎么样,学会了么?

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自微信公众号。
原始发表:2020-09-17,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

本文分享自 百味科研芝士 微信公众号,前往查看

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划  ,欢迎热爱写作的你一起参与!

评论
登录后参与评论
0 条评论
热度
最新
推荐阅读
相关产品与服务
图片处理
图片处理(Image Processing,IP)是由腾讯云数据万象提供的丰富的图片处理服务,广泛应用于腾讯内部各产品。支持对腾讯云对象存储 COS 或第三方源的图片进行处理,提供基础处理能力(图片裁剪、转格式、缩放、打水印等)、图片瘦身能力(Guetzli 压缩、AVIF 转码压缩)、盲水印版权保护能力,同时支持先进的图像 AI 功能(图像增强、图像标签、图像评分、图像修复、商品抠图等),满足多种业务场景下的图片处理需求。
领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档