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Sushi包绘制常见基因坐标图

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用户1680321
发布2020-09-16 16:59:44
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发布2020-09-16 16:59:44
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文章被收录于专栏:yw的数据分析yw的数据分析
介绍

Sushi包能绘制多种常见的基因组格式的图,包括bed, bedpe, bedgraph,Hic矩阵,也能绘制Manhattan图,基因结构图。

代码讲解

这次为了方便查找,我将他们分到了不同文章里面,每篇文章的封面就是对应的效果图。

  1. bedgraph

http://54.189.29.251/2020/09/04/绘制bedgraph格式图/

  1. 多个bedgraph

http://54.189.29.251/2020/09/04/绘制bedgraph格式图/

  1. HiC交互矩阵

http://www.thecodesearch.com/2020/09/06/绘制hic交互图/

  1. Bedpe格式

http://www.thecodesearch.com/2020/09/09/sushi包绘制bedpe图/

  1. bed格式

http://www.thecodesearch.com/2020/09/09/sushi包绘制bed图/

  1. Manhattan图

http://www.thecodesearch.com/2020/09/13/sushi包绘制manhattan图/

  1. 基因结构图

http://www.thecodesearch.com/2020/09/13/sushi包绘制基因结构图/

  1. 放大图的一部分

http://www.thecodesearch.com/2020/09/13/sushi绘制部分放大的bedgraph图/

原始出处

http://www.thecodesearch.com/2020/09/04/sushi包介绍/

本文参与 腾讯云自媒体同步曝光计划,分享自作者个人站点/博客。
原始发表:2020-09-14 ,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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