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iTOL更新了

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Listenlii-生物信息知识分享
发布2020-05-29 11:19:36
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发布2020-05-29 11:19:36
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文章被收录于专栏:Listenlii的生物信息笔记

4.1号Nucleic AcidsResearch刊出了iTOL更新到V4版本的文章。

InteractiveTree Of Life (https://itol.embl.de) V4版本引入了四种新的数据集类型以及许多新特性。扩展了注释功能,并为许多元素添加了新的控制选项。实现了交互式的在线编辑器,在web界面中直接提供数据集的创建和编辑。字体全面支持utf-8编码。

最关键的是,iTOL v4是第一个支持直接可视化Qiime 2得到的进化树和相关注释的工具。

QIIME 2 得到的QZA trees (Phylogeny[Rooted] or Phylogeny[Unrooted])可以直接上传。

加上新增的4种数据类型,iTOL目前可支持18种数据类型。

新增的四种数据类型:

(A)图片:位图和SVG图像可以连接到任意的节点。

(B)多重序列比对的结果:支持FASTA的多序列比对。自动计算序列一致性和残差图。

(C)分支和标签的形式:树节点和标签的颜色和样式现在可以通过单独的数据集指定。可以有多个不同的样式数据集,允许用户在不同的颜色和样式之间切换。

(D)折线图。

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原始发表:2019-04-02,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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