组合多个GSE数据集进行meta分析不妨先去冗余

生信技能树

发布于 2018-12-18 14:48:24

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发现一个工具，发表在 BMC Bioinformatics201415:323 https://doi.org/10.1186/1471-2105-15-323，很简单的设计，就是考虑到做多个GSE数据集的meta分析的人越来越多了，但是很多人都瞎搞，整合数据集的时候没有去冗余。

所以作者开发这个R包: DupChecker: a bioconductor package for checking high-throughput genomic data redundancy in meta-analysis

既然是R包，那么学习起来就很容易了。

meta分析都想做，结果第一步就失策，哈哈，反思一下！

我的领域最出名的GSE数据集的meta分析应该就是2011年的TNBC了，如下：

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原始发表：2018-11-22，如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除