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如何在CVM上安装R

原创

信姜缘

发布于 2018-07-19 09:45:51

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文章被收录于专栏：云计算教程系列云计算教程系列

介绍

R是一种开源编程语言，专门用于统计计算和图形绘制。R在统计的基础下，被广泛用于开发统计软件和数据分析。R是一种日益流行且可扩展的语言，拥有活跃的社区，为特定的研究领域提供了许多软件包，使其适用于许多领域。

在本教程中，我们将安装R并演示如何从官方的Comprehensive R Archive Network（CRAN）添加软件包。

准备

学习本教程，需要一台安装好Ubuntu系统的服务器,我建议您使用腾讯云免费的开发者专属在线实验平台进行试验。

至少 1GB的RAM
具有sudo权限的非root用户

直接使用腾讯云配置Ubuntu 云服务器，本教程的默认版本为Ubuntu 18.04，具体的配置指南详见云学院教程。

接下来就可以开始下面的安装步骤。

第一步，安装R

由于R是一个快速发展的项目，因此Ubuntu的存储库并不总是提供最新稳定的版本，因此我们将首先添加由CRAN维护的外部存储库。

注意： CRAN在其网络中维护存储库，但并非所有外部存储库都是可靠的。请务必仅从受信任的来源安装

我们先添加相关的GPG密钥。

$ sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9

当我们运行命令时，我们将得到以下输出：

Executing: /tmp/apt-key-gpghome.4BZzh1TALq/gpg.1.sh --keyserver
keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
gpg: key 51716619E084DAB9: public key "Michael Rutter \<marutter\@gmail.com\>"
imported
gpg: Total number processed: 1
gpg: imported: 1

一旦我们拥有了可信密钥，我们就可以添加存储库。请注意，如果您不使用18.04版本，则可以从R Project Ubuntu列表中找到相应的存储库。

$  sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/'

在显示的输出中，您将获得以下内容的输出：

...
Get:5 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ InRelease [3609 B]
...
Get:6 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ Packages [21.0 kB]
...

现在，我们需要运行update，以便更新存储库中的包清单。

$   sudo apt update

输出如下：

...

Hit:2 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ InRelease
...

如果得到上面的输出中，说明我们已成功添加了存储库。我们可以肯定我们不会意外安装旧版本。

此时，我们已准备好使用以下命令安装R.

$   sudo apt install r-base

如果提示确认安装，请按 y 继续。

截至撰写本文时，CRAN的最新稳定版R为3.5.1，当您启动R时会显示对应的版本号。

由于我们计划为系统上的每个用户安装一个示例包，我们将以root身份启动R，以便所有用户可以自动使用这些库。或者，如果您在R不使用命令的情况下运行该命令sudo，则可以为您的用户设置个人库。

$  sudo -i R

R version 3.5.1 (2018-07-02) -- "Feather Spray"
Copyright (C) 2018 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
...
Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.
>

输出结果如上证实我们已经成功安装了R并进入了它的交互式shell界面。

第二步，从CRAN安装R软件包

R的优势之一是其可用的附加包装丰富。出于演示目的，我们将安装txtplot（一个输出ASCII图形的库），其中包括散点图，线图，密度图，acf和条形图：

>   install.packages('txtplot')

注意：以下输出显示了软件包的安装位置。 ... Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’ (as ‘lib’ is unspecified) ... 这个站点范围的路径是可用的，我们用root身份运行R，这是使所有用户都可以使用该程序包的正确位置。

当安装完成后，我们可以加载txtplot：

>   library('txtplot')

如果没有错误消息，则表示库已成功加载。现在让我们使用一个示例来演示它，该示例演示了带有轴标签的基本绘图功能。由R的datasets包提供的20世纪20年代汽车速度和停车所需距离的数据示例

$   txtplot(cars[,1], cars[,2], xlab = 'speed', ylab = 'distance')

      +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
  120 +                                                   *    +
      |                                                        |
d 100 +                                                   *    +
i     |                                    *                *  |
s  80 +                          *         *                   +
t     |                                       * *    *    *    |
a  60 +                          *  *      *    *      *       +
n     |                        *         * *  * *              |
c  40 +                *       * *    *  *    * *              +
e     |         *      *  * *  * *  *                          |
   20 +           *    *  * *       *                          +
      |  *      *    *                                         |
    0 +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
           5          10           15          20          25   
							speed

如果您有兴趣了解更多信息txtplot，请help(txtplot)在R解释器中使用。

任何预编译的包都可以从CRAN安装install.packages()。要了解有关可用内容的更多信息，您可以通过CRAN

找到按官方软件包列表。