CIRCOS增加热图、点图、线图和区块属性

<<include etc/colors_fonts_patterns.conf>>

# # 必须的部分，控制染色体信息显示
# # 之前两篇教程为了方便理解ideogram和ticks都是直接写在主配置文件的
# # 但通常实际使用时会拆分成不同文件，方便管理，所以这里采用了引用方式
# # 具体解释都见前面的文章
<<include ideogram.conf>>
<<include ticks.conf>>

# 定义输出
<image>
<<include etc/image.conf>>
file*=test.circos.png
dir*=./
</image>

# karyotype定义染色体的名字、ID、起始位置信息，是绘制图的根本
# 具体解释看前面2篇文章
karyotype = test.chromsomes.circos_input.txt

# `chromosome_units`定义染色体一个单位的大小，缩写为`u`。若`chromosome_units=1000000`, 
 则`10u=10000000`。
# 后面会用到这个单位，尤其是ticks中
chromosomes_units =1000000
chromosomes_display_default = yes

# 大标签highlights，复数定义里面有多个highlight
<highlights>

# 高亮的区域放在 <highlight>标签中，配置简单，给定文件名和内外半径就好
# 文件格式见下面解释
<highlight>
file=HL1.bed.circos_input.txt
r0=0.914285714286r
r1=0.991428571429r
</highlight>

# 高亮的区域放在 <highlight>标签中，配置简单，给定文件名和内外半径就好
# 文件格式见下面解释
<highlight>
file=HL2.bed.circos_input.txt
r0=0.828571428571r
r1=0.905714285714r
</highlight>

# 高亮的区域放在 <highlight>标签中，配置简单，给定文件名和内外半径就好
# 文件格式见下面解释
<highlight>
file=HL3.bed.circos_input.txt
r0=0.742857142857r
r1=0.82r
</highlight>

</highlights>

# 定义绘制的线图、点图、热图、直方图等，复数plots
<plots>

# 全局属性定义
color = spectral-7-div-rev
stroke_thickness = 1
stroke_color = black
scale_log_base = 0.5

# 其中一个子图，给定文件名，内外半径，和绘制类型
# 文件格式见下面解释
<plot>
file=Heatmap1.bed.circos_input.txt
type=line
r0=0.657142857143r
r1=0.734285714286r
</plot>

# 其中一个子图，给定文件名，内外半径，和绘制类型
# 文件格式见下面解释
<plot>
file=Heatmap2.bed.circos_input.txt
type=scatter
r0=0.571428571429r
r1=0.648571428571r
</plot>

# 其中一个子图，给定文件名，内外半径，和绘制类型
# 文件格式见下面解释
<plot>
file=Heatmap3.bed.circos_input.txt
type=histogram
r0=0.485714285714r
r1=0.562857142857r
</plot>

# 其中一个子图，给定文件名，内外半径，和绘制类型
# 文件格式见下面解释
<plot>
file=Heatmap4.bed.circos_input.txt
type=heatmap
r0=0.4r
r1=0.477142857143r
</plot>

</plots>

<<include etc/housekeeping.conf>>
max_points_per_track*  =  2500000
data_out_of_range* = trim

##chr - ID LABEL START END COLOR
chr - chr1 hs1 0 248956422 chr1
chr - chr2 hs2 0 242193529 chr2
chr - chr3 hs3 0 198295559 chr3
chr - chr4 hs4 0 190214555 chr4
chr - chr5 hs5 0 181538259 chr5

#ParentID    START    END    ATTRIBUTE
#ParentID对应于karyotype文件的ID（第3列)
#ATTRIBUTE列颜色的获取看前面两篇的介绍以获知有多少可用颜色
chr1 0 6422000 fill_color=vlyellow
chr1 12447822 24895644 fill_color=vlpred
chr1 136926042 149373864 fill_color=vlppurple
chr1 236508618 248956422 fill_color=vlporange
chr2 0 2421000 fill_color=vlpred
chr2 36329031 48438708 fill_color=vlpgreen
chr2 193754832 205864509 fill_color=vlpred
chr2 133206447 145316124 fill_color=vlyellow
chr3 59488668 69403446 fill_color=vlpred
chr3 128892114 138806892 fill_color=vlpblue
chr3 1800000 198295559 fill_color=vlpred
chr4 0 2145550 fill_color=vlpgreen
chr4 95107280 104618008 fill_color=vlpblue
chr4 133150192 142660920 fill_color=vlppurple
chr4 190000000 190214555 fill_color=vlpgreen
chr5 0 1538259 fill_color=vlpblue
chr5 27230739 36307652 fill_color=vvlpgreen
chr5 72615304 81692217 fill_color=vvlyellow
chr5 127076782 136153695 fill_color=vvlporange
chr5 15382590 15392590 fill_color=vlpblue

#ParentID    START    END    Value
#ParentID对应于karyotype文件的ID (第3列)
#Value列为我们想展示的值
chr1 0 12447822 1
chr1 12447822 24895644 2
chr1 211612974 224060796 18
chr1 224060796 236508618 19
chr1 236508618 248956422 20
chr2 0 12109677 1
chr2 12109677 24219354 2
chr2 24219354 36329031 3
chr2 36329031 48438708 4
chr2 48438708 60548385 5
chr2 205864509 217974186 18
chr2 217974186 230083863 19
chr2 230083863 242193529 20
chr3 0 9914778 1
chr3 9914778 19829556 2
chr3 19829556 29744334 3
chr3 29744334 39659112 4
chr3 39659112 49573890 5
chr4 0 9510728 1
chr4 9510728 19021456 2
chr4 19021456 28532184 3
chr4 28532184 38042912 4
chr4 133150192 142660920 15
chr4 171193104 180703832 19
chr4 180703832 190214555 20
chr5 0 9076913 1
chr5 9076913 18153826 2
chr5 18153826 27230739 3
chr5 154307521 163384434 18
chr5 163384434 172461347 19
chr5 172461347 181538259 20